More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1377 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
453 aa  900    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.86 
 
 
420 aa  412  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.97 
 
 
420 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
429 aa  393  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.225919  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.19 
 
 
436 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.73 
 
 
294 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  40.34 
 
 
315 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
313 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
292 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
309 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
308 aa  179  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
293 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
291 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.49 
 
 
318 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.2 
 
 
320 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
292 aa  176  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
305 aa  176  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  38.34 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
285 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.33288  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.05 
 
 
301 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  37.1 
 
 
307 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
307 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
317 aa  173  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  41.02 
 
 
314 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  41.02 
 
 
314 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
299 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
306 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
295 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 
288 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
292 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
300 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
299 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
296 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  40.91 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
314 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  34.92 
 
 
294 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
319 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
293 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.25 
 
 
287 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
279 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
302 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
295 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
310 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
345 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.457033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
316 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
314 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
402 aa  162  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
309 aa  161  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  34.98 
 
 
300 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
345 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163981  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
310 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.36 
 
 
314 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
299 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  39.34 
 
 
317 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
318 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.670475  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  34.76 
 
 
321 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
294 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
292 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
297 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  34.84 
 
 
321 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
308 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000379306  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
318 aa  157  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
316 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
317 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
307 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
319 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000915897 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
293 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
316 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
309 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.4 
 
 
308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000461706  normal  0.23331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
313 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  36.36 
 
 
310 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  36.36 
 
 
310 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  36.36 
 
 
310 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
310 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
310 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
310 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
296 aa  153  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  35.5 
 
 
319 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 
319 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
317 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000449996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
310 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
311 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
310 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
305 aa  153  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.028536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1449  lactose transport system permease protein  33.99 
 
 
290 aa  153  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0650773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00699527 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  36.36 
 
 
310 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  35.78 
 
 
293 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
333 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.52 
 
 
321 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0550121  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
316 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
294 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>