More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1052 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1052  ABC transporter related  100 
 
 		 220 aa  434  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1529  ABC transporter related  97.27 
 
 		 568 aa  400  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000802446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  79.55 
 
 		 572 aa  334  5.999999999999999e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1506  ABC transporter related  54.55 
 
 		 564 aa  237  9e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00391095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1465  ABC transporter related  54.55 
 
 		 564 aa  237  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  53.42 
 
 		 571 aa  234  9e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  53.42 
 
 		 571 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1507  ABC transporter related  51.82 
 
 		 572 aa  218  6e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.112704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1466  ABC transporter related  51.82 
 
 		 572 aa  218  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  48.2 
 
 		 598 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.85 
 
 		 586 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1815  ABC transporter  46.85 
 
 		 370 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 575 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.85 
 
 		 586 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  46.64 
 
 		 583 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.85 
 
 		 586 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  47.95 
 
 		 577 aa  197  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.95 
 
 		 586 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 581 aa  197  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 586 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  46.85 
 
 		 586 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  46.4 
 
 		 586 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.4 
 
 		 586 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  46.15 
 
 		 455 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  45.25 
 
 		 556 aa  194  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 623 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  43.44 
 
 		 578 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  43.3 
 
 		 578 aa  190  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  44.8 
 
 		 738 aa  190  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  45.29 
 
 		 582 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  43.3 
 
 		 578 aa  190  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45 
 
 		 577 aa  190  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.84 
 
 		 582 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 581 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  43.05 
 
 		 618 aa  188  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  46.36 
 
 		 602 aa  188  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.84 
 
 		 597 aa  188  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  46.61 
 
 		 578 aa  188  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  44.34 
 
 		 584 aa  188  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  46.19 
 
 		 594 aa  187  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  46.61 
 
 		 578 aa  188  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  45.25 
 
 		 601 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  45.25 
 
 		 601 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  44.14 
 
 		 596 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  45.87 
 
 		 591 aa  187  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.09 
 
 		 601 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.84 
 
 		 582 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  42.08 
 
 		 586 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  44.34 
 
 		 581 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  43.89 
 
 		 602 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  42.73 
 
 		 592 aa  186  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  40.91 
 
 		 594 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  44.59 
 
 		 575 aa  186  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  44.39 
 
 		 582 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  44.39 
 
 		 582 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  43.95 
 
 		 582 aa  185  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  43.44 
 
 		 622 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  185  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  45.93 
 
 		 583 aa  184  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  44.8 
 
 		 610 aa  184  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  41.82 
 
 		 581 aa  184  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  47.69 
 
 		 593 aa  185  6e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 613 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  41.18 
 
 		 584 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.09 
 
 		 608 aa  184  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  44.55 
 
 		 598 aa  184  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  44.34 
 
 		 572 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2272  ABC transporter related  40.83 
 
 		 613 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  41.44 
 
 		 573 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 628 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  44.34 
 
 		 585 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.08 
 
 		 605 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  48.83 
 
 		 727 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  45.25 
 
 		 611 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.34 
 
 		 578 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  44.39 
 
 		 582 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  40.72 
 
 		 586 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  46.85 
 
 		 588 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.19 
 
 		 600 aa  182  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  44.14 
 
 		 600 aa  182  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  44.55 
 
 		 586 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.62 
 
 		 596 aa  182  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  45.45 
 
 		 601 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  43.44 
 
 		 588 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  45.25 
 
 		 610 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>