13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2333 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2333  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  285  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00580597  hitchhiker  0.00510153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01170  hypothetical protein  63.09 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0170  hypothetical protein  63.09 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0537  hypothetical protein  50.35 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2434  hypothetical protein  51.15 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137351  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3179  hypothetical protein  64.41 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3117  hypothetical protein  45.54 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100633  normal  0.0374199 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3472  hypothetical protein  42.06 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4079  hypothetical protein  41.49 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241871 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  29.7 
 
 		 709 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05869  hypothetical protein  27.21 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  34.92 
 
 		 731 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000447  hypothetical protein  24 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00123037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>