31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1938 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2170  hypothetical protein  79.55 
 
 		 395 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2662  hypothetical protein  79.55 
 
 		 395 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1938  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  794    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.915381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3141  hypothetical protein  79.29 
 
 		 395 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3321  hypothetical protein  76.75 
 
 		 399 aa  617  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.242267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39000  hypothetical protein  74.75 
 
 		 399 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00275655  normal  0.388299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2244  hypothetical protein  46.7 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.0297405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1931  hypothetical protein  46.17 
 
 		 393 aa  318  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.930432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1868  hypothetical protein  45.24 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1395  hypothetical protein  31.46 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2873  hypothetical protein  26.06 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2512  hypothetical protein  27.86 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231134  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2725  hypothetical protein  27.36 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3009  hypothetical protein  28.54 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0425000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1045  hypothetical protein  28.54 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2937  hypothetical protein  27.14 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.336844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2601  hypothetical protein  26.81 
 
 		 443 aa  106  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000556017  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2453  hypothetical protein  26.99 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0689  hypothetical protein  28.35 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0866657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1982  hypothetical protein  26.97 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000915947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3575  hypothetical protein  25.85 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2424  hypothetical protein  25.41 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1287  hypothetical protein  27.03 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.46065e-21 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3046  hypothetical protein  24.94 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1367  hypothetical protein  26.01 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0893  hypothetical protein  25.81 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218351  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2343  hypothetical protein  28.44 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.902991 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3256  hypothetical protein  29.17 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3661  hypothetical protein  31.91 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.159613  normal  0.176734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1652  hypothetical protein  31.72 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0118  hypothetical protein  25.53 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>