20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1807 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1807  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  222  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3059  hypothetical protein  45.61 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1216  hypothetical protein  44.74 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934469  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2776  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0187  hypothetical protein  45.45 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704355  normal  0.309268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0189  hypothetical protein  44.55 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0132  hypothetical protein  49.56 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633937  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5059  hypothetical protein  46.79 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1078  hypothetical protein  44.04 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1312  hypothetical protein  47.22 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00893975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0303  hypothetical protein  38.74 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0934  hypothetical protein  37.39 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0964  hypothetical protein  37.39 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1290  hypothetical protein  34.82 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3767  hypothetical protein  52 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0052  hypothetical protein  34.44 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0435  hypothetical protein  36.84 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3109  hypothetical protein  32.73 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0395  hypothetical protein  34.75 
 
 		 129 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2825  hypothetical protein  42.25 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712693  normal  0.211414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>