18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1182 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1182  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.6386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2494  hypothetical protein  80.87 
 
 		 333 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4744  hypothetical protein  74.59 
 
 		 304 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1658  hypothetical protein  70.34 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0109  hypothetical protein  61.79 
 
 		 305 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2357  hypothetical protein  64.1 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0335886  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1619  hypothetical protein  64.91 
 
 		 314 aa  374  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.175531  normal  0.0226832 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0867  hypothetical protein  58.72 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0890858  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2728  hypothetical protein  63.41 
 
 		 304 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0756893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0203  hypothetical protein  64.66 
 
 		 316 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3686  hypothetical protein  58.71 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2447  hypothetical protein  50.47 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.938237 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4314  hypothetical protein  35.84 
 
 		 427 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5360  hypothetical protein  39.07 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0641445 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5090  hypothetical protein  28.29 
 
 		 423 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.948231  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5048  hypothetical protein  30.43 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0131682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1538  hypothetical protein  29.57 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.292569  normal  0.943893 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_219  hypothetical protein  22.46 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>