178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0139 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0139  glutaminase  100 
 
 		 302 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3197  glutaminase  84.11 
 
 		 302 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0628801  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  85.43 
 
 		 302 aa  530  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  85.1 
 
 		 306 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3373  glutaminase  85.76 
 
 		 302 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2488  glutaminase, putative  81.46 
 
 		 302 aa  510  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2292  glutaminase  80.79 
 
 		 302 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0498348  decreased coverage  0.0000324531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  69.21 
 
 		 303 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  63.67 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01329  glutaminase  65.23 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  62.58 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1322  glutaminase  63.58 
 
 		 304 aa  387  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.152397 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  63 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1126  glutaminase  63.58 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0389369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  62 
 
 		 316 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1328  glutaminase  63.12 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00785417  hitchhiker  0.00333617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1222  glutaminase  62.91 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0064518  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  63.12 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3193  glutaminase  62.79 
 
 		 304 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.256164  normal  0.605856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  62.79 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  63.12 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  62.79 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  63.12 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  63.12 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  63.12 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2695  glutaminase  60.6 
 
 		 304 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  62.79 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1183  glutaminase  63.25 
 
 		 304 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000358411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1254  glutaminase  63.25 
 
 		 304 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000302254  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1184  glutaminase  63.25 
 
 		 304 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000737214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2487  glutaminase  62.91 
 
 		 304 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.702442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3036  glutaminase  62.46 
 
 		 304 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103836  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2697  glutaminase  62.79 
 
 		 304 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.718556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3050  glutaminase  62.79 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000590255  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  61.79 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  63.12 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  63.12 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  61.79 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  62.13 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  63.12 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1638  glutaminase  62.46 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1697  glutaminase  62.46 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1645  glutaminase  62.46 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00641427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1630  glutaminase  62.46 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.637067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1111  glutaminase  62.79 
 
 		 304 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000036158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1810  glutaminase  61.79 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2870  glutaminase  60.6 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2007  glutaminase  60 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  53.77 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  54.15 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1741  L-glutaminase  51.16 
 
 		 304 aa  321  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  53.16 
 
 		 304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  53.16 
 
 		 304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  53.16 
 
 		 304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  53.16 
 
 		 304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  53.82 
 
 		 304 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  54.15 
 
 		 333 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  52.82 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  52.82 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  52.82 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  53.16 
 
 		 304 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  53.29 
 
 		 306 aa  315  6e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  52 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  51 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  52.16 
 
 		 304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  52.16 
 
 		 304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  51.83 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  50.84 
 
 		 304 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  52.3 
 
 		 309 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  52.3 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  51.16 
 
 		 346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  49.83 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  52.63 
 
 		 315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7656  Glutaminase  51.83 
 
 		 316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3965  Glutaminase  52.82 
 
 		 306 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  50.98 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  51.63 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  50.99 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  51.97 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.394459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  49.18 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  49.18 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  51.32 
 
 		 311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  50.33 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09673  glutaminase  49.17 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  49.67 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  49.67 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4418  Glutaminase  49.33 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  49.35 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  46.38 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  47.37 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0137  Glutaminase  52.12 
 
 		 312 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0977  Glutaminase  47.18 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4564  glutaminase  49.16 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3548  L-glutaminase  45.6 
 
 		 314 aa  255  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  41.75 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  38.87 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  38.87 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  38.87 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  38.87 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  38.87 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>