More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0136 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0136  asparaginase  100 
 
 		 329 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01180  L-Asparaginase, type I  65.45 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0495  asparaginase  64.22 
 
 		 329 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0529  asparaginase  63.91 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.974663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35440  L-asparaginase I  66.77 
 
 		 328 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000850733  normal  0.0205246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0550  asparaginase  65.14 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.139855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0538  asparaginase  65.14 
 
 		 332 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2988  L-asparaginase I  66.97 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5053  asparaginase  57.1 
 
 		 334 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672232  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5501  L-asparaginase I  57.1 
 
 		 334 aa  348  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5627  asparaginase  56 
 
 		 335 aa  345  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0567778  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1778  L-asparaginase, type I  39.42 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285439  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1963  cytoplasmic asparaginase I  37.35 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145247  normal  0.0808598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2070  cytoplasmic asparaginase I  37.06 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3330  L-asparaginase, type I  38.76 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1908  cytoplasmic asparaginase I  37.06 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1940  cytoplasmic asparaginase I  36.66 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.680808  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2421  cytoplasmic asparaginase I  36.76 
 
 		 337 aa  208  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2295  cytoplasmic asparaginase I  36.76 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000365461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2146  cytoplasmic asparaginase I  36.39 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00274242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2412  cytoplasmic asparaginase I  36.76 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031003  hitchhiker  0.000169421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2054  cytoplasmic asparaginase I  36.76 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2050  cytoplasmic asparaginase I  36.76 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0327097  hitchhiker  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1902  cytoplasmic asparaginase I  36.18 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104501  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2298  cytoplasmic asparaginase I  35.99 
 
 		 337 aa  205  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000114011  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2079  cytoplasmic asparaginase I  36.98 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2312  cytoplasmic asparaginase I  34.99 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000448344  hitchhiker  0.000363201 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1722  cytoplasmic asparaginase I  36.76 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0150989  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2254  cytoplasmic asparaginase I  35.21 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000486388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  35.42 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1969  cytoplasmic asparaginase I  36.8 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0253632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1983  cytoplasmic asparaginase I  36.2 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339543  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2092  cytoplasmic asparaginase I  36.2 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43603  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03045  cytoplasmic asparaginase I  35.17 
 
 		 337 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002912  L-asparaginase  35.4 
 
 		 337 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2347  cytoplasmic asparaginase I  35.91 
 
 		 338 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109422  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2158  cytoplasmic asparaginase I  36.2 
 
 		 337 aa  195  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1969  cytoplasmic asparaginase I  34.8 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.316331  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2265  cytoplasmic asparaginase I  36.5 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05280  L-asparaginase type I family protein  35.12 
 
 		 335 aa  192  9e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3394  cytoplasmic asparaginase I  36.07 
 
 		 336 aa  192  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2052  cytoplasmic asparaginase I  35.71 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2723  cytoplasmic asparaginase I  36.12 
 
 		 338 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  hitchhiker  0.00370317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1680  cytoplasmic asparaginase I  35.59 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2211  cytoplasmic asparaginase I  34.8 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1580  cytoplasmic asparaginase I  34.52 
 
 		 337 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1851  cytoplasmic asparaginase I  35.42 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0116887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2584  cytoplasmic asparaginase I  33.73 
 
 		 337 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1388  cytoplasmic asparaginase I  35.42 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0184597  normal  0.373487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1405  cytoplasmic asparaginase I  35.42 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  normal  0.0252011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1881  cytoplasmic asparaginase I  35.42 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00109074  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1421  cytoplasmic asparaginase I  35.42 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0271356  normal  0.712342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01648  cytoplasmic asparaginase I  35.31 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00821331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2022  cytoplasmic asparaginase I  35.12 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  35.12 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  35.12 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1991  cytoplasmic asparaginase I  35.12 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.310429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1865  cytoplasmic asparaginase I  35.12 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  35.12 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2488  cytoplasmic asparaginase I  35.12 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1424  cytoplasmic asparaginase I  35.12 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202154  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  34.82 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  34.82 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2037  asparaginase  38 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2653  asparaginase  35.09 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3607  asparaginase  39.76 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0542  L-asparaginase, type I  31.25 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289217 
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  32.75 
 
 		 359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2233  L-asparaginase, type I  32.61 
 
 		 379 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4133  asparaginase  36.89 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000160051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5475  L-asparaginase, type I  33.52 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.241616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  31.2 
 
 		 347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  31.67 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  30.14 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  31.05 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  30.15 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  29.71 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  29.97 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  28.66 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  26.87 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  27.25 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  27.25 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  26.65 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  26.65 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  26.87 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  26.65 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  26.65 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1807  asparaginase  30 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0241049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0159  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  31.18 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0190  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  32.97 
 
 		 731 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20905  predicted protein  29.39 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08169  asparaginase (Eurofung)  30.89 
 
 		 543 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.808143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  26.38 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  31.44 
 
 		 335 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  25.57 
 
 		 418 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  25.29 
 
 		 418 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  25.29 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00170  asparaginase, putative  29.27 
 
 		 394 aa  119  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000410367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  27.33 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  24.71 
 
 		 426 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>