14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4121 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4121  von Willebrand factor type A  100 
 
 
390 aa  797    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0223  von Willebrand factor type A  35.04 
 
 
396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 
334 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
345 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  32.95 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2702  TadE family protein  36.13 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  36.9 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.56 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  28.93 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  23.93 
 
 
313 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  35.71 
 
 
327 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  27.08 
 
 
356 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1491  hypothetical protein  32.08 
 
 
1258 aa  43.1  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.813394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
334 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>