21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3788 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3788  putative seryl-tRNA synthetase (serine--tRNA ligase) (SerRS)  100 
 
 		 313 aa  626  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0858  hypothetical protein  57.65 
 
 		 352 aa  343  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.364297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1573  hypothetical protein  56.17 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0858  hypothetical protein  57.1 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1194  hypothetical protein  57 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  normal  0.262929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2488  hypothetical protein  57.24 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000914073  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0018  hypothetical protein  55.41 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000671428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1664  hypothetical protein  58.45 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1337  hypothetical protein  57.4 
 
 		 333 aa  311  6.999999999999999e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2899  hypothetical protein  58.33 
 
 		 333 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3230  hypothetical protein  57.04 
 
 		 319 aa  305  9.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0765  hypothetical protein  57.19 
 
 		 329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0327  hypothetical protein  55.7 
 
 		 314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.739831  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2845  hypothetical protein  55.48 
 
 		 338 aa  302  6.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1665  hypothetical protein  57.25 
 
 		 329 aa  296  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1631  hypothetical protein  57.25 
 
 		 329 aa  296  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1140  hypothetical protein  56.88 
 
 		 329 aa  295  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0714  hypothetical protein  57.34 
 
 		 349 aa  294  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0285775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1817  hypothetical protein  54.15 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.172258  normal  0.343692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2228  hypothetical protein  53.87 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.508663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2364  hypothetical protein  58.42 
 
 		 329 aa  285  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>