221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3159 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3159  Alkaline phosphatase  100 
 
 
571 aa  1190    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0625023  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1983  Alkaline phosphatase  31.07 
 
 
627 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2010  Alkaline phosphatase  31.07 
 
 
627 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.208798  normal  0.40879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  30.79 
 
 
945 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  32.61 
 
 
2701 aa  136  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  30.7 
 
 
2182 aa  124  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  28.73 
 
 
1587 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  31.75 
 
 
2852 aa  117  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  32.73 
 
 
615 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  30.82 
 
 
434 aa  111  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  30.48 
 
 
434 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49678  predicted protein  25.2 
 
 
729 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.452781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  28.76 
 
 
631 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0512  alkaline phosphatase  30.53 
 
 
521 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.01 
 
 
3977 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  27.34 
 
 
388 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  29.31 
 
 
461 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  28.87 
 
 
461 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  29.31 
 
 
461 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  29.31 
 
 
461 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  29.31 
 
 
461 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  29.31 
 
 
461 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  29.31 
 
 
461 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  28.97 
 
 
461 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  28.62 
 
 
461 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  28.62 
 
 
461 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  28.22 
 
 
461 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  27.45 
 
 
454 aa  99  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  27.61 
 
 
497 aa  98.2  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3187  alkaline phosphatase  28.18 
 
 
468 aa  97.4  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  25.17 
 
 
525 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  27.53 
 
 
433 aa  94.4  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  29.55 
 
 
584 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  24.23 
 
 
525 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  29.01 
 
 
481 aa  92.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  25.68 
 
 
470 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  27.81 
 
 
671 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  24.41 
 
 
559 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  26 
 
 
455 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  25.15 
 
 
552 aa  92.8  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  25.43 
 
 
436 aa  91.7  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  26.02 
 
 
548 aa  90.9  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  29.68 
 
 
582 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0192  alkaline phosphatase  25 
 
 
400 aa  89  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.282333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  28.57 
 
 
585 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  28.48 
 
 
471 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  25.77 
 
 
530 aa  87  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  28.99 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  28.99 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  28.85 
 
 
575 aa  86.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  26 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  28.3 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  24.07 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  24.08 
 
 
527 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  26 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  24.07 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  26 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  28.43 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  28.3 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  24.83 
 
 
454 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  27.9 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  28.3 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  28.8 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  25.78 
 
 
503 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  27.9 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0399  Alkaline phosphatase  27.3 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  24.92 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  27.97 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  28.43 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  28.92 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  27.94 
 
 
589 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  25.67 
 
 
439 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3638  Alkaline phosphatase  27.03 
 
 
515 aa  84  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.431708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  27.34 
 
 
518 aa  83.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  25.68 
 
 
537 aa  83.6  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  27.1 
 
 
585 aa  83.6  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  27.1 
 
 
585 aa  83.6  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  25.33 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  25.7 
 
 
486 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  25.51 
 
 
640 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  26.39 
 
 
554 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  25.53 
 
 
616 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  28.52 
 
 
575 aa  82.4  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  25.08 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  24.09 
 
 
532 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3809  alkaline phosphatase  28.39 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227259  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  24 
 
 
464 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  24 
 
 
464 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  23.75 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2291  alkaline phosphatase  28.26 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1946  alkaline phosphatase  28.26 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  25.85 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1835  alkaline phosphatase  28.26 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541069  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  25 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  25.44 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1216  alkaline phosphatase  26.74 
 
 
494 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516371  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  27.22 
 
 
565 aa  81.3  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02493  extracellular phytase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14030)  26.97 
 
 
663 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.468824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0924  Alkaline phosphatase  26.81 
 
 
527 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000229427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4018  Alkaline phosphatase  28.16 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.306331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>