18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2255 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2255  protein of unknown function DUF1571  100 
 
 		 279 aa  580  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3142  protein of unknown function DUF1571  27.89 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0412  putative lipoprotein transmembrane  22.98 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0427  lipoprotein transmembrane  23.4 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1956  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1766  hypothetical protein  24.52 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000723457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0129  hypothetical protein  24.52 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000566472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1801  hypothetical protein  24.52 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00434642  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1277  hypothetical protein  24.52 
 
 		 323 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000935938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1780  hypothetical protein  24.52 
 
 		 332 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0149316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3594  hypothetical protein  26.12 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1671  putative signal peptide transmembrane protein  23.29 
 
 		 367 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.505557  normal  0.644124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1509  hypothetical protein  24.07 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.728748  hitchhiker  0.000463306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2036  putative lipoprotein transmembrane  25.22 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000209555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1053  hypothetical protein  24.07 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1533  hypothetical protein  24.07 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2779  putative signal peptide transmembrane protein  26.29 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0265643  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4673  hypothetical protein  24.88 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0103539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>