21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0858 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0858  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  708    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.364297  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3788  putative seryl-tRNA synthetase (serine--tRNA ligase) (SerRS)  57.65 
 
 
313 aa  343  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0018  hypothetical protein  53.89 
 
 
326 aa  342  5e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000671428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3230  hypothetical protein  56.29 
 
 
319 aa  340  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283864  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1573  hypothetical protein  55.59 
 
 
329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2488  hypothetical protein  54.66 
 
 
331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000914073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1194  hypothetical protein  54.04 
 
 
345 aa  335  5e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  normal  0.262929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0765  hypothetical protein  58.44 
 
 
329 aa  334  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2845  hypothetical protein  54.52 
 
 
338 aa  333  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00165169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1664  hypothetical protein  53.87 
 
 
334 aa  332  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1337  hypothetical protein  54.13 
 
 
333 aa  330  2e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2899  hypothetical protein  54.6 
 
 
333 aa  329  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0327  hypothetical protein  52.94 
 
 
314 aa  325  5e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.739831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0858  hypothetical protein  53.07 
 
 
329 aa  325  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2364  hypothetical protein  57.14 
 
 
329 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1817  hypothetical protein  51.38 
 
 
329 aa  316  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.172258  normal  0.343692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2228  hypothetical protein  50.92 
 
 
328 aa  305  6e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.508663  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0714  hypothetical protein  52.09 
 
 
349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0285775  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1140  hypothetical protein  53.51 
 
 
329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1665  hypothetical protein  52.84 
 
 
329 aa  299  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1631  hypothetical protein  52.84 
 
 
329 aa  299  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>