16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0324 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0324  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 373 aa  754    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.26 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  21.69 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.45 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  19.95 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  22.7 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.46 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.85 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  21.16 
 
 		 792 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  23.83 
 
 		 359 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  22.4 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  20.26 
 
 		 1153 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  18.77 
 
 		 360 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  21.61 
 
 		 360 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 		 360 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>