122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0015 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0015  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  100 
 
 
444 aa  906    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1307  metal dependent phosphohydrolase  36.53 
 
 
446 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0511  metal dependent phosphohydrolase  33.23 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2274  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 
469 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1407  hypothetical protein  30.52 
 
 
412 aa  161  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184009  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0287  metal dependent phosphohydrolase  36.43 
 
 
469 aa  160  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0438301 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1939  metal dependent phosphohydrolase  35.47 
 
 
473 aa  160  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2547  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 
475 aa  160  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2120  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 
467 aa  159  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1178  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 
458 aa  159  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2141  metal dependent phosphohydrolase  33.07 
 
 
402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.655755  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0059  DNA-directed DNA polymerase  32.29 
 
 
401 aa  156  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.157318  hitchhiker  0.00506783 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2172  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 
469 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1084  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
410 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1174  metal dependent phosphohydrolase  31.01 
 
 
458 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1501  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.604824  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1412  metal-dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 
400 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000393703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0777  metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 
458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0760  metal dependent phosphohydrolase  32.59 
 
 
407 aa  146  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2410  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
411 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1663  metal dependent phosphohydrolase  38.22 
 
 
395 aa  142  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2443  metal dependent phosphohydrolase  29.48 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2577  metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0118  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 
401 aa  141  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.835732  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0921  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 
472 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1569  metal dependent phosphohydrolase  36.86 
 
 
414 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1680  metal dependent phosphohydrolase  40.69 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2579  metal dependent phosphohydrolase  39.57 
 
 
407 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5172  metal dependent phosphohydrolase  37.25 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4439  metal dependent phosphohydrolase  37.25 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2262  metal dependent phosphohydrolase  37.45 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1630  hypothetical protein  35.23 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0511  HD superfamily phosphohydrolase  28.5 
 
 
448 aa  131  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.159978  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1210  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
434 aa  130  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2948  hypothetical protein  29.79 
 
 
413 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.160964  normal  0.0130066 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0223  HD superfamily phosphohydrolase  32.52 
 
 
454 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.237797  hitchhiker  0.00000000000130835 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1071  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
399 aa  127  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0173536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5228  HD domain-containing protein  36.73 
 
 
434 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5059  dGTP triphosphohydrolase  36.73 
 
 
434 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5627  HD domain-containing protein  36.73 
 
 
434 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5471  HD domain protein  36.73 
 
 
434 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5508  HD domain-containing protein  37.65 
 
 
483 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5076  dGTP triphosphohydrolase  36.73 
 
 
434 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5557  HD domain protein  36.73 
 
 
434 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3358  metal dependent phosphohydrolase  36.73 
 
 
433 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000060416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5502  HD domain protein  36.73 
 
 
434 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2329  metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 
424 aa  123  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.751432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5449  HD domain protein  36.33 
 
 
434 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0251  HD domain-containing protein  33.2 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0158  hypothetical protein  29.7 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.2104  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0865  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2129  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000800981  hitchhiker  0.0000761992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3900  metal dependent phosphohydrolase  35.92 
 
 
434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2905  metal dependent phosphohydrolase  37.67 
 
 
409 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0550186  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03551  HD superfamily phosphohydrolase  33.2 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0626  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0641  metal-dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1754  metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 
405 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0194685  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1130  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 
435 aa  120  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04151  HD superfamily phosphohydrolase  35.04 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.761915  normal  0.477621 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1706  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0614585 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1700  metal dependent phosphohydrolase  34.19 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1177  HD superfamily phosphohydrolase  34.48 
 
 
447 aa  117  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00433685  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1577  metal dependent phosphohydrolase  31.23 
 
 
407 aa  117  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00516026 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3468  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 
432 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3017  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 
438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000311981  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl650  HD phosphohydrolase  32.87 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0265  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0512  HD domain-containing protein  26.68 
 
 
438 aa  114  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1851  metal dependent phosphohydrolase  36.4 
 
 
425 aa  113  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111611  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08156  hypothetical protein  32.88 
 
 
406 aa  113  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03591  HD superfamily phosphohydrolase  33.77 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603218  normal  0.796242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2345  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1624  metal dependent phosphohydrolase  33.46 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0458  metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.847424  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0703  HD domain protein  33.8 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03471  HD superfamily phosphohydrolase  30.65 
 
 
418 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0224  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
455 aa  109  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.41122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6492  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 
420 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0499013  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2641  metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 
441 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1039  HC superfamily phosphohydrolase  34.32 
 
 
411 aa  107  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.914108  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0329  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 
418 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1790  HD superfamily phosphohydrolase  32.89 
 
 
430 aa  106  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1281  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
408 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000286263  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03491  HD superfamily phosphohydrolase  30.42 
 
 
418 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1245  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 
461 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0575  metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 
509 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270439  normal  0.229911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1042  metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 
415 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0731  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
475 aa  103  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1210  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 
470 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 
471 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0483  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 
421 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.256165  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2292  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
487 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0322637 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1934  metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 
473 aa  100  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1824  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 
436 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4281  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  31.82 
 
 
416 aa  99.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.282547  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1167  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 
498 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464914  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21871  HD superfamily phosphohydrolase  35.16 
 
 
413 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1945  metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2121  metal-dependent phosphohydrolase  29 
 
 
616 aa  94  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>