58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3183 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3183  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605999  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2792  hypothetical protein  46.74 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0568081 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4427  hypothetical protein  44 
 
 
306 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0476773 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2040  hypothetical protein  43.1 
 
 
299 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.229443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0360  protein of unknown function DUF1009  45.42 
 
 
282 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10118  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2449  hypothetical protein  50 
 
 
287 aa  198  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4505  hypothetical protein  40.5 
 
 
285 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1108  hypothetical protein  43.42 
 
 
300 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1150  hypothetical protein  43.42 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2845  hypothetical protein  41.39 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3256  protein of unknown function DUF1009  40.66 
 
 
285 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1142  hypothetical protein  44.04 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0304239  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2512  hypothetical protein  43.17 
 
 
290 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1706  hypothetical protein  41.39 
 
 
285 aa  175  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.349467  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0593  hypothetical protein  38.69 
 
 
290 aa  175  8e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0138266  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1393  hypothetical protein  44.28 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78507  hitchhiker  0.00530667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1787  protein of unknown function DUF1009  44.4 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240236  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1847  hypothetical protein  41.39 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.730915  normal  0.19763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2448  hypothetical protein  38.83 
 
 
284 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.448088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1594  protein of unknown function DUF1009  42.96 
 
 
293 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.983213  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2816  hypothetical protein  41.39 
 
 
285 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1392  hypothetical protein  45.07 
 
 
297 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1852  hypothetical protein  38.21 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000781514  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1598  hypothetical protein  38.91 
 
 
286 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.653331  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2142  hypothetical protein  43.59 
 
 
273 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3376  protein of unknown function DUF1009  34.41 
 
 
270 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3908  hypothetical protein  41.67 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0741095  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1375  hypothetical protein  34.78 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000871979  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2359  protein of unknown function DUF1009  31.56 
 
 
294 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3435  hypothetical protein  38.75 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.853398  normal  0.369907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1373  hypothetical protein  41.11 
 
 
273 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.848143  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5219  protein of unknown function DUF1009  37.5 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2449  hypothetical protein  38.35 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  hitchhiker  0.00174485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1527  protein of unknown function DUF1009  40.81 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  31.75 
 
 
649 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0897  hypothetical protein  34.18 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2715  hypothetical protein  41.11 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1403  hypothetical protein  39.46 
 
 
262 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408064  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2839  hypothetical protein  33.57 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1125  hypothetical protein  35.27 
 
 
271 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.33509  decreased coverage  0.00103642 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2226  protein of unknown function DUF1009  32.01 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.212193  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1086  hypothetical protein  34.18 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1145  protein of unknown function DUF1009  33.82 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1214  protein of unknown function DUF1009  33.82 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1503  conserved hypothetical protein DUF1009  38.31 
 
 
265 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217673  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5142  protein of unknown function DUF1009  38.21 
 
 
282 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal  0.0362287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4677  hypothetical protein  37.5 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.299114  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2350  protein of unknown function DUF1009  29.39 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0644  hypothetical protein  41.09 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650994  normal  0.611382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3002  protein of unknown function DUF1009  32 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17540  hypothetical protein  30.85 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0371  protein of unknown function DUF1009  26.88 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0143196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4554  hypothetical protein  30.18 
 
 
301 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.679907  normal  0.0581006 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0079  hypothetical protein  29.24 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000676342  hitchhiker  0.00000000000219127 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0884  protein of unknown function DUF1009  28.41 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1010  protein of unknown function DUF1009  26.37 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00304045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1287  protein of unknown function DUF1009  27.27 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0767794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3873  hypothetical protein  30.36 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.429993  normal  0.0170553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>