18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3162 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3162  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 300 aa  587  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  0.182433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  27.72 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.02 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  28.41 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  26.94 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  27.92 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  35.29 
 
 		 495 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  39.8 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  35.29 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  35.29 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  35.29 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  35.29 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  35.29 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  35.29 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  28.78 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  31.16 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  38.78 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  38.78 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>