More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3153 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3153  histidine kinase  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.115047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67 
 
 
468 aa  287  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
617 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
911 aa  165  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
523 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
844 aa  161  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
770 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
717 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
502 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 
1352 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 
778 aa  158  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
1274 aa  157  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 
733 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  38.73 
 
 
470 aa  155  3e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  43.62 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  39.22 
 
 
470 aa  154  1e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  40.59 
 
 
771 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 
600 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
1138 aa  151  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  35.68 
 
 
1035 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  35.92 
 
 
1410 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  40.1 
 
 
771 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
836 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
798 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
1055 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
389 aa  148  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
775 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
969 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  35.21 
 
 
1035 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
769 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  37.81 
 
 
773 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
728 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
784 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
1000 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  41.09 
 
 
556 aa  144  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
1276 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  38.12 
 
 
774 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  42.08 
 
 
783 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
377 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  42.08 
 
 
783 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
779 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
774 aa  142  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
1296 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
579 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
484 aa  141  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
786 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
1192 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
775 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
530 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
511 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  39.9 
 
 
508 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
531 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  34.25 
 
 
532 aa  138  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  37.05 
 
 
786 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
533 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
786 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
782 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
512 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 
704 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
530 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
562 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  34.15 
 
 
513 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0561  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
640 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393536  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
518 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  38.36 
 
 
576 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
513 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
764 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
511 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
536 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  36.54 
 
 
565 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  36.82 
 
 
587 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  35.32 
 
 
511 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  40.87 
 
 
803 aa  133  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36.36 
 
 
1046 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
536 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  36.32 
 
 
511 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
511 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1473  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
1380 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  36.82 
 
 
587 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  36.82 
 
 
587 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  36.82 
 
 
587 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  36.82 
 
 
587 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  37.31 
 
 
587 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
676 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  35.47 
 
 
513 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  35.47 
 
 
513 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  37.81 
 
 
790 aa  131  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  37.44 
 
 
587 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
827 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  37.44 
 
 
587 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  38.97 
 
 
599 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  36.19 
 
 
548 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
494 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 
754 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
631 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
687 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 
1120 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
797 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  36.32 
 
 
587 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
620 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>