73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2034 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2034  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1620  hypothetical protein  67.07 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0876  hypothetical protein  60.92 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271927  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3695  hypothetical protein  65.33 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3694  hypothetical protein  55.42 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1161  hypothetical protein  60.27 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5968  hypothetical protein  74.36 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5200  hypothetical protein  74.03 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1042  hypothetical protein  69.33 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.980568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6866  hypothetical protein  67.07 
 
 		 91 aa  94.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  0.022304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3737  hypothetical protein  58.82 
 
 		 83 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00728994  normal  0.292015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2872  hypothetical protein  65.91 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0123  hypothetical protein  68.42 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2750  hypothetical protein  65.91 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.897901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2977  hypothetical protein  65.91 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2535  hypothetical protein  61.64 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2948  hypothetical protein  57.14 
 
 		 93 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0989  hypothetical protein  67.95 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.684189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4670  hypothetical protein  67.95 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315448  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0166  hypothetical protein  53.66 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3227  hypothetical protein  62.79 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0084  hypothetical protein  52.44 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0077  hypothetical protein  53.16 
 
 		 93 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1221  hypothetical protein  66.67 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.661908  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1426  hypothetical protein  65.38 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1405  hypothetical protein  65.38 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3979  hypothetical protein  65.38 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121303  normal  0.274015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3367  hypothetical protein  62.79 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2443  hypothetical protein  63.41 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2680  hypothetical protein  68 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3293  hypothetical protein  68 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.587635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3594  hypothetical protein  68 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2066  hypothetical protein  60.98 
 
 		 87 aa  83.6  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576605  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3699  hypothetical protein  62.5 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1502  hypothetical protein  50.6 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2497  hypothetical protein  50.65 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.514422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3184  hypothetical protein  56.63 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1740  hypothetical protein  52 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0180  hypothetical protein  60 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1691  hypothetical protein  60 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5542  hypothetical protein  46.75 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1419  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2635  hypothetical protein  48.19 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1049  hypothetical protein  46.84 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7962  hypothetical protein  44 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.027631  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1752  hypothetical protein  54.65 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4248  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287019  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1313  hypothetical protein  55.71 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.214688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2455  conserved hypothetical protein-like protein  61.33 
 
 		 280 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1734  hypothetical protein  51.32 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0130  hypothetical protein  57.33 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1557  hypothetical protein  43.84 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0557  hypothetical protein  42.67 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0164  hypothetical protein  50.67 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1798  hypothetical protein  50.67 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.320432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1480  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0462  hypothetical protein  42.11 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.781265  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3610  hypothetical protein  49.33 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2078  hypothetical protein  49.33 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0915  hypothetical protein  55.36 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3346  hypothetical protein  49.33 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319255  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0576  hypothetical protein  42.11 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.191205  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1659  hypothetical protein  48 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1346  hypothetical protein  52.56 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.439397  hitchhiker  0.000296751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0339  hypothetical protein  55.41 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0341011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3985  hypothetical protein  52.56 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1696  hypothetical protein  52.73 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000802562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1916  hypothetical protein  49.3 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.863299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0430  hypothetical protein  50.91 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2963  hypothetical protein  45.21 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2697  hypothetical protein  45.45 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  51.11 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3122  hypothetical protein  50.6 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.59002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>