31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1985 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1985  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  272  9e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0772  hypothetical protein  54.89 
 
 		 133 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000821647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2620  hypothetical protein  53.49 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2947  hypothetical protein  51.49 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2381  hypothetical protein  51.54 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0797  hypothetical protein  44.03 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  43.75 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4494  hypothetical protein  29.01 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  26.47 
 
 		 162 aa  52  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  33.93 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  25.19 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  28.57 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  28.18 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  27.27 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1469  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.29 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  30.28 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  34.91 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  34.91 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  27.27 
 
 		 176 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  34.91 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  34.91 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  34.91 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  34.91 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  34.91 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  26.09 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  31.15 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  26.09 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  26.09 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  28.57 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  29.2 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  27.93 
 
 		 138 aa  40  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>