19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1175 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3560  alkaline phosphatase domain-containing protein  100 
 
 
678 aa  1364    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1175  alkaline phosphatase domain-containing protein  100 
 
 
678 aa  1364    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0064  hypothetical protein  36.3 
 
 
664 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.834835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1124  PglZ domain protein  35.88 
 
 
677 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0434385 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1491  PglZ domain protein  36.14 
 
 
668 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0817  hypothetical protein  35.98 
 
 
677 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.062184  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0434  alkaline phosphatase domain-containing protein  34 
 
 
554 aa  319  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0641  hypothetical protein  27.54 
 
 
512 aa  104  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0502748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1040  two-component response regulator  23.89 
 
 
518 aa  67.4  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.429651  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08151  response regulator  24.69 
 
 
516 aa  66.6  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2906  response regulator receiver protein  24.09 
 
 
517 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3191  hypothetical protein  24.77 
 
 
829 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2518  response regulator receiver protein  25.93 
 
 
519 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.487815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3042  response regulator receiver protein  23.99 
 
 
524 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0742856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0710  bacteriophage resistance gene pglZ  22.99 
 
 
914 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205582  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2955  bacteriophage resistance gene PglZ  25.17 
 
 
893 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418689  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0928  response regulator  21.14 
 
 
518 aa  48.1  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.581359 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4282  PglZ domain protein  20.59 
 
 
518 aa  47.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.769544  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1282  response regulator receiver protein  21.65 
 
 
517 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00300616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>