30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0484 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0484  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  191  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2347  hypothetical protein  65.59 
 
 
103 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.307924  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1981  hypothetical protein  65.59 
 
 
103 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.11308  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2465  hypothetical protein  64.52 
 
 
100 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.705928  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34640  hypothetical protein  64.13 
 
 
98 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3831  hypothetical protein  61.29 
 
 
96 aa  120  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0747  hypothetical protein  66.3 
 
 
99 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000864185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0644  hypothetical protein  66.3 
 
 
99 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0602249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0837  hypothetical protein  63.44 
 
 
101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.05984  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2196  hypothetical protein  60.22 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.250793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0420  hypothetical protein  60.64 
 
 
100 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.3293  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3836  hypothetical protein  58.7 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.242387  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0973  hypothetical protein  61.54 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0086355  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2128  hypothetical protein  56.99 
 
 
95 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70369  normal  0.722848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2247  hypothetical protein  61.63 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0347  hypothetical protein  59.78 
 
 
100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2049  hypothetical protein  58.7 
 
 
95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4140  hypothetical protein  53.85 
 
 
119 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4271  hypothetical protein  52.75 
 
 
119 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4293  hypothetical protein  52.75 
 
 
119 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746324  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1935  hypothetical protein  55.43 
 
 
96 aa  102  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.157401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15960  hypothetical protein  57.65 
 
 
115 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4283  hypothetical protein  56.04 
 
 
170 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1968  hypothetical protein  58.02 
 
 
118 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.426641  normal  0.147802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1762  hypothetical protein  55.26 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0762473  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0003  hypothetical protein  57.14 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000143416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0141  hypothetical protein  53.75 
 
 
114 aa  87  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0143  hypothetical protein  53.75 
 
 
114 aa  87  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2143  hypothetical protein  62.32 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00966347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7257  hypothetical protein  40.85 
 
 
82 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.560667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>