More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0051 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0051  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 585 aa  1179    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725839 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1271  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2929  signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 578 aa  124  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 662 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2700  signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 592 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 		 594 aa  111  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 		 597 aa  102  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2724  signal transduction histidine kinase  21.62 
 
 		 613 aa  94.7  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.524296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 570 aa  94  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 603 aa  91.3  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 872 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 215 aa  88.2  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 839 aa  87.8  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 1390 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  24.3 
 
 		 783 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  28.69 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 1253 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 631 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 547 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 1654 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 571 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2023  signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 932 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 815 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 964 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  31.69 
 
 		 754 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 1714 aa  80.9  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 545 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 657 aa  78.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 674 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3926  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  27.93 
 
 		 650 aa  77.4  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1182 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.11 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 585 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 1183 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 1676 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 1560 aa  73.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 945 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 912 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.54 
 
 		 1239 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 721 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0589  signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 550 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0760576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  29.57 
 
 		 1248 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 790 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 991 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30 
 
 		 704 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 3706 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 1177 aa  72  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 913 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 771 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 771 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1093 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  24.78 
 
 		 744 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1093 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  29.91 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 878 aa  70.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 572 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 1227 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 892 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  33.08 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  28.85 
 
 		 624 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.37 
 
 		 1668 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 1051 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  26.9 
 
 		 1663 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 864 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 874 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  25 
 
 		 895 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 875 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 752 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 871 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 813 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 613 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 		 532 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 727 aa  67  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 1051 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 414 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 616 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 420 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 541 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>