189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0002 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0002  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  301  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000108771  hitchhiker  1.00132e-23 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3372  rhodanese-related sulfurtransferase  53.19 
 
 
149 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0687  rhodanese domain-containing protein  54.61 
 
 
140 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1490  rhodanese domain-containing protein  52.21 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1274  Rhodanese domain protein  54.07 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0733136  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0512  Rhodanese domain protein  52.35 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00637526  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0515  rhodanese domain-containing protein  54.68 
 
 
137 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0525  rhodanese-like protein  54.68 
 
 
137 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0537  rhodanese domain-containing protein  54.68 
 
 
137 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0661648  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0535  Rhodanese domain protein  53.62 
 
 
142 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4035  Rhodanese domain protein  51.8 
 
 
137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10394  hypothetical protein  50.71 
 
 
140 aa  131  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112032  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0220  rhodanese domain-containing protein  55.07 
 
 
137 aa  130  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2946  Rhodanese domain protein  50.34 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3477  Rhodanese domain protein  52.52 
 
 
135 aa  121  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2287  rhodanese-like protein  43.88 
 
 
209 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3765  rhodanese-like protein  43.48 
 
 
150 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0703444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5459  rhodanese-like protein  45.26 
 
 
154 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2060  rhodanese domain-containing protein  45.26 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5927  rhodanese-like protein  44.53 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2150  rhodanese domain-containing protein  44.53 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2187  rhodanese domain-containing protein  45.26 
 
 
182 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.992479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2168  rhodanese domain-containing protein  44.53 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.784132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4005  rhodanese domain-containing protein  50.36 
 
 
156 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816307  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3513  rhodanese domain-containing protein  50.36 
 
 
156 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2626  rhodanese-like protein  50 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35020  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.72 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1556  hypothetical protein  48.2 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1482  hypothetical protein  43.36 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2059  rhodanese-like protein  45.93 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0322  Rhodanese domain protein  42.54 
 
 
132 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.089082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0151  rhodanese-like domain protein  42.54 
 
 
132 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3646  Rhodanese domain protein  42.75 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2139  rhodanese-like protein  45.65 
 
 
176 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109425  decreased coverage  0.0000830085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1520  hypothetical protein  42.65 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000699946  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2616  Rhodanese domain protein  41.91 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00605824  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0117  rhodanese-like protein  42.86 
 
 
130 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0120  rhodanese-like domain-containing protein  48.18 
 
 
155 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3119  Rhodanese domain protein  46.72 
 
 
160 aa  103  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0929  rhodanese-like domain-containing protein  48.92 
 
 
155 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0452  rhodanese-like domain-containing protein  48.92 
 
 
155 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.401061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0195  rhodanese-like domain-containing protein  48.92 
 
 
155 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  48.92 
 
 
155 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2446  rhodanese-like protein  42.14 
 
 
171 aa  103  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000105937  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2063  rhodanese-like protein  44.2 
 
 
154 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1121  rhodanese domain-containing protein  43.8 
 
 
154 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.461947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0235  rhodanese-like protein  40 
 
 
128 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.661399  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  39.26 
 
 
149 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0366  rhodanese-like domain-containing protein  48.2 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3516  rhodanese domain-containing protein  46.38 
 
 
146 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1909  rhodanese/Cdc25 fold  48.2 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.636231  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1822  rhodanese domain-containing protein  48.2 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1843  rhodanese-like domain-containing protein  40.88 
 
 
154 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1744  hypothetical protein  41.61 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2771  rhodanese-like protein  41.61 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2254  hypothetical protein  41.61 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3066  hypothetical protein  41.61 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2636  hypothetical protein  41.61 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2692  hypothetical protein  41.61 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.340906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1525  hypothetical protein  41.61 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131173  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0027  hypothetical protein  44.6 
 
 
155 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.335991  normal  0.134752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0538  rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 
158 aa  98.2  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2535  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.607232  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0086  rhodanese-like protein  40.6 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20970  Rhodanese-like protein  46.38 
 
 
174 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00660232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1890  Rhodanese domain protein  46.04 
 
 
161 aa  97.1  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3644  Rhodanese domain protein  44.85 
 
 
136 aa  96.7  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  38.81 
 
 
130 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3859  rhodanese domain-containing protein  46.1 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0048  rhodanese-like protein  43.2 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1177  Rhodanese domain protein  45.19 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2392  Rhodanese domain protein  44.03 
 
 
141 aa  94.7  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881675  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1085  Rhodanese domain protein  45.19 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2167  rhodanese domain-containing protein  46.48 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.548621  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4172  rhodanese domain-containing protein  42.45 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.170844 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  42.34 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3613  rhodanese-like protein  43.8 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4049  rhodanese-like protein  41.38 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1293  rhodanese domain-containing protein  43.07 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5788  rhodanese domain-containing protein  43.17 
 
 
159 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00528237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0171  rhodanese-like protein  35.77 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4949  Rhodanese domain protein  41.61 
 
 
137 aa  87.8  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0296  hypothetical protein  41.22 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0150  Rhodanese domain protein  42.75 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0157  Rhodanese domain protein  41.22 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1742  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.354198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1257  hypothetical protein  42.22 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.737183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3209  rhodanese domain-containing protein  34.11 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0532  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210744  normal  0.0949792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0548  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0955  rhodanese-like protein  35 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0394414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3127  hypothetical protein  35.62 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154894  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1529  rhodanese-like protein  32.14 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155027  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2329  Rhodanese domain protein  32.87 
 
 
197 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3551  hypothetical protein  34.29 
 
 
222 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502988 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  29.06 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  26.28 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2496  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0373  rhodanese-like  27.78 
 
 
181 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370743  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>