More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1955 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1955  transport system permease protein  100 
 
 		 307 aa  564  1e-160  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.443661  hitchhiker  1.2483500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1092  transport system permease protein  90.23 
 
 		 307 aa  395  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00868751  hitchhiker  0.00152758 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2137  transport system permease protein  57.99 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1518  transport system permease protein  60.33 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000431091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  34.51 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  33.55 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  33.79 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  31.16 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  35.86 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  35.81 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  30.8 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  30.56 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  29.86 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  35.74 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  32 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  38.54 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  30.18 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  29.86 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  34.83 
 
 		 341 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2248  transport system permease protein  36.52 
 
 		 335 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.49 
 
 		 678 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4340  iron ABC transporter, permease protein FitD  32.16 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.49 
 
 		 678 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  35.61 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  35.17 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  32.38 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  30.71 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  34.4 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  34.52 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3756  transport system permease protein  33.66 
 
 		 343 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.49 
 
 		 678 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  33.57 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  30.99 
 
 		 359 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  34.55 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.49 
 
 		 678 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  28.52 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.49 
 
 		 678 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.88 
 
 		 694 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1389  iron (III) ABC transporter, permease  32.01 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.953687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  29.51 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.49 
 
 		 678 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  33.55 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0655  transport system permease protein  35.35 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  29.18 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  32.75 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3320  iron ABC transporter, permease protein FitD  31.8 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0698736 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  33 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0761  iron-compound ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  36.75 
 
 		 340 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  33.89 
 
 		 346 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  35.16 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  29.07 
 
 		 374 aa  99.4  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  32.27 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  33.22 
 
 		 352 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  29.97 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  33.22 
 
 		 352 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  32.39 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  28.72 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  32.39 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  31.15 
 
 		 391 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  36.4 
 
 		 340 aa  99  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  30.38 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.14 
 
 		 678 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1137  transport system permease protein  35.31 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  33.45 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  26.33 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  33.9 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  32.85 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  32.1 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  30.58 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2065  transport system permease protein  34.01 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  30.71 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37 
 
 		 704 aa  97.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  32.3 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  29.15 
 
 		 345 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  29.68 
 
 		 336 aa  97.1  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  32.3 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2788  transport system permease protein  34.97 
 
 		 335 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.890347 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  32.3 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  31.47 
 
 		 368 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1787  hemin ABC transporter, permease protein, putative  28.84 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.55 
 
 		 367 aa  97.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  32.51 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  28.47 
 
 		 347 aa  96.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  33.22 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  35.93 
 
 		 350 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  32.89 
 
 		 336 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  30.55 
 
 		 348 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  32.49 
 
 		 346 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.31 
 
 		 346 aa  96.3  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  30.85 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  28.84 
 
 		 328 aa  95.9  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  35.45 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  28.84 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0513  iron ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 353 aa  95.9  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132048  normal  0.109169 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  33.01 
 
 		 353 aa  95.5  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>