22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2708 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2708  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  281  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1215  hypothetical protein  63.93 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0834  hypothetical protein  54.03 
 
 		 125 aa  153  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000171191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003544  hypothetical protein  49.19 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02217  hypothetical protein  50.81 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1663  hypothetical protein  31.37 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.039673  normal  0.0367113 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1595  hypothetical protein  31.33 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000010265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2500  hypothetical protein  32.19 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000375646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1844  hypothetical protein  32.19 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000036265  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2507  hypothetical protein  30.5 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000287675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2620  hypothetical protein  31.51 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000901127  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2336  hypothetical protein  30.77 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1436  hypothetical protein  32.73 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00146467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2261  hypothetical protein  31.69 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  32 
 
 		 249 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  32 
 
 		 249 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  32 
 
 		 249 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  28.18 
 
 		 520 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1939  hypothetical protein  29.93 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1844  hypothetical protein  30.28 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000465325  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  32.99 
 
 		 244 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>