More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1638 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1638  integrase catalytic subunit  100 
 
 
302 aa  639    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330516  normal  0.0835787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
386 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
386 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
386 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
386 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
386 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
386 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
386 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
386 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
386 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
386 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  45.19 
 
 
289 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 
386 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 
386 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 
386 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 
386 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 
386 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 
386 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  41.88 
 
 
294 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  41.88 
 
 
294 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  41.88 
 
 
294 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  41.88 
 
 
294 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  41.88 
 
 
294 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  45.66 
 
 
289 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  45.66 
 
 
289 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2887  Integrase catalytic region  41.64 
 
 
271 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1393  Integrase catalytic region  41.64 
 
 
271 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0425  integrase catalytic subunit  44.62 
 
 
269 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1049  integrase catalytic subunit  44.62 
 
 
269 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3021  integrase catalytic subunit  44.62 
 
 
269 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  40.96 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  40.22 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  40.22 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4660  integrase catalytic region  43.87 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.462988  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4596  integrase catalytic region  43.87 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.930794 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4449  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0972291  normal  0.591502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1727  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1928  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0656  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0132  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1073  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2006  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2651  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2008  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3065  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0174203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3189  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3550  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4460  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.07 
 
 
288 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  40.82 
 
 
291 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0374  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0495  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0657  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0684  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0892  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0983  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1024  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1079  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1083  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1129  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1134  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1465  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1515  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1904  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2026  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2031  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2056  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2130  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2135  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2169  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2171  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2315  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2369  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2462  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2734  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3398  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3570  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3606  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3610  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4183  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4277  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4294  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4300  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4442  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4580  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0024  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0483506  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0029  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0037  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0054  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0066  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0091  ISSod1, transposase OrfB  43.87 
 
 
269 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  41.26 
 
 
271 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2548  integrase catalytic region  43.49 
 
 
269 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.0518637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  39.48 
 
 
296 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2305  integrase catalytic region  43.49 
 
 
269 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.209191  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3584  integrase catalytic region  43.49 
 
 
269 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2987  integrase catalytic region  43.49 
 
 
269 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1118  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3113  integrase catalytic region  43.49 
 
 
269 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2660  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
269 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>