28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0859 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0859  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  248  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  33.64 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1946  hypothetical protein  36.94 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000181986  normal  0.0225511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  35.85 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2030  hypothetical protein  34.23 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000942918  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2676  hypothetical protein  36.04 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208691  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  35.85 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  35.85 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  35.85 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  35.85 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2142  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  33.96 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  33.96 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  33.96 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  33.96 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2314  hypothetical protein  34.86 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0867  hypothetical protein  33 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1903  hypothetical protein  31.36 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000176347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2142  hypothetical protein  30.91 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000300583  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003401  hypothetical protein  34 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000284049  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1711  hypothetical protein  34.95 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02381  hypothetical protein  33 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00395  hypothetical protein  28.7 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243677  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  30.84 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  34.44 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  30.84 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1787  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  47  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.196852  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3876  hypothetical protein  26.61 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>