27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0437 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0437  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  683    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.474392  normal  0.018516 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4571  putative enzyme  22.92 
 
 
312 aa  92.4  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1177  sulfotransferase  25.08 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0381  hypothetical protein  24.41 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.593972  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3976  hypothetical protein  24.63 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2683  sulfotransferase-like protein  25.08 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0562  hypothetical protein  23.29 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1941  hypothetical protein  22.35 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.944736  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18740  hypothetical protein  22.86 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.856365  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5203  hypothetical protein  21.27 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1834  hypothetical protein  22.38 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.275113  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1483  sulfotransferase domain-containing protein  22.51 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1798  hypothetical protein  27.47 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3147  hypothetical protein  23.23 
 
 
447 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130118  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4096  sulfotransferase  32.5 
 
 
282 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8599  hypothetical protein  23.6 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  23.3 
 
 
2762 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0452  sulfotransferase domain-containing protein  26.72 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279842  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  25.44 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1323  sulfotransferase domain-containing protein  22.88 
 
 
423 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2761  sulfotransferase domain-containing protein  23.33 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3223  hypothetical protein  32.95 
 
 
260 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0426372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2617  hypothetical protein  22.88 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0179  sulfotransferase domain-containing protein  22.88 
 
 
384 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0154  sulfotransferase domain-containing protein  22.88 
 
 
384 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1026  sulfotransferase domain-containing protein  22.88 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0173  hypothetical protein  29.11 
 
 
284 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.919474  normal  0.0584223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>