More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3553 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03930  excinuclease ABC subunit A  43.49 
 
 		 940 aa  776    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3934  excinuclease ABC, A subunit  43.49 
 
 		 940 aa  776    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  46.24 
 
 		 946 aa  836    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  48.15 
 
 		 937 aa  872    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  43.99 
 
 		 944 aa  806    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_002950  PG1036  excinuclease ABC, A subunit  44.32 
 
 		 967 aa  766    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000712855 
 
 
-
 
NC_002950  PG2210  excinuclease ABC, A subunit  52.37 
 
 		 952 aa  980    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  45.31 
 
 		 954 aa  824    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  46.46 
 
 		 944 aa  857    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0916  excinuclease ABC, A subunit  45.4 
 
 		 931 aa  795    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0420  excinuclease ABC subunit A  43.14 
 
 		 954 aa  788    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790766  normal  0.236129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  46.09 
 
 		 958 aa  843    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0920  excinuclease ABC, A subunit  44.93 
 
 		 943 aa  797    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1709  excinuclease ABC subunit A  44.98 
 
 		 942 aa  770    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1104  excinuclease ABC subunit A  45.06 
 
 		 974 aa  802    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4030  excinuclease ABC, A subunit  43.17 
 
 		 950 aa  765    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  43.6 
 
 		 992 aa  803    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  46.19 
 
 		 958 aa  845    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  46.19 
 
 		 958 aa  845    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl059  repair endonuclease subunit A  44.48 
 
 		 949 aa  778    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  46.19 
 
 		 958 aa  845    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3095  excinuclease ABC, A subunit  42.57 
 
 		 955 aa  764    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0451  excinuclease ABC subunit A  44.41 
 
 		 951 aa  808    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  44.2 
 
 		 951 aa  802    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  43.39 
 
 		 961 aa  802    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1685  excinuclease ABC subunit A  42.87 
 
 		 968 aa  781    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0473  excinuclease ABC subunit A  43.67 
 
 		 941 aa  773    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.78914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  45.63 
 
 		 945 aa  849    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0367  excinuclease ABC subunit A  42.74 
 
 		 954 aa  775    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  46.91 
 
 		 1008 aa  845    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  44.87 
 
 		 940 aa  785    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1568  excinuclease ABC subunit A  43.42 
 
 		 993 aa  770    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.524179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3591  excinuclease ABC subunit A  44.2 
 
 		 965 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240208  normal  0.0431372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  43.81 
 
 		 944 aa  805    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  46.87 
 
 		 937 aa  854    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6109  excinuclease ABC subunit A  43.1 
 
 		 961 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  49.3 
 
 		 956 aa  904    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1301  excinuclease ABC subunit A  49.09 
 
 		 942 aa  919    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  47.94 
 
 		 937 aa  865    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0324  excinuclease ABC, A subunit  43.22 
 
 		 935 aa  771    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  46.19 
 
 		 958 aa  845    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0848  excinuclease ABC subunit A  42.29 
 
 		 1003 aa  776    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.23949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  43.43 
 
 		 944 aa  778    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0774  excinuclease ABC, A subunit  43.95 
 
 		 946 aa  772    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1752  excinuclease ABC subunit A  44.94 
 
 		 950 aa  806    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  46.77 
 
 		 971 aa  838    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  45.47 
 
 		 966 aa  817    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  42.69 
 
 		 976 aa  785    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  42.74 
 
 		 970 aa  794    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  45.54 
 
 		 953 aa  827    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  43.61 
 
 		 946 aa  801    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  43.14 
 
 		 939 aa  773    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4108  excinuclease ABC subunit A  42.74 
 
 		 957 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  46.69 
 
 		 941 aa  861    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2758  excinuclease ABC subunit A  43.32 
 
 		 1008 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0448  excinuclease ABC subunit A  43.33 
 
 		 957 aa  779    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2081  excinuclease ABC subunit A  43.07 
 
 		 1013 aa  769    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0851595  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1960  excinuclease ABC, A subunit  42.57 
 
 		 968 aa  774    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0313  excinuclease ABC subunit A  43.25 
 
 		 955 aa  776    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0776  excinuclease ABC subunit A  46.41 
 
 		 981 aa  832    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.839433  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  47.48 
 
 		 973 aa  901    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1098  excinuclease ABC subunit A  45.25 
 
 		 963 aa  766    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  42.93 
 
 		 967 aa  784    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  43.98 
 
 		 973 aa  776    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  45.02 
 
 		 923 aa  774    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0146  excinuclease ABC, A subunit  43.99 
 
 		 942 aa  778    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1396  excinuclease ABC subunit A  44.61 
 
 		 970 aa  787    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0158  excinuclease ABC subunit A  44.13 
 
 		 947 aa  803    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3698  excinuclease ABC subunit A  63.98 
 
 		 944 aa  1168    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  46.14 
 
 		 939 aa  873    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  46.03 
 
 		 939 aa  872    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1128  excinuclease ABC subunit A  45.04 
 
 		 943 aa  797    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0168519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  42.8 
 
 		 1004 aa  801    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2748  excinuclease ABC subunit A  42.8 
 
 		 940 aa  764    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0880957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  46.36 
 
 		 942 aa  838    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1885  excinuclease ABC subunit A  44.72 
 
 		 957 aa  804    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414426  normal  0.621255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2839  excinuclease ABC, A subunit  42.89 
 
 		 961 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.696224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  43.41 
 
 		 945 aa  791    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  46.22 
 
 		 943 aa  808    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  47.2 
 
 		 952 aa  833    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  47.02 
 
 		 953 aa  826    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  46.11 
 
 		 952 aa  800    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  44.11 
 
 		 941 aa  777    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  43.61 
 
 		 975 aa  791    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  44.41 
 
 		 950 aa  813    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  46.03 
 
 		 947 aa  845    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  47.35 
 
 		 954 aa  857    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1939  excinuclease ABC subunit A  49.84 
 
 		 950 aa  896    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0317613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  43.35 
 
 		 1019 aa  799    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  43.98 
 
 		 973 aa  776    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0369  excinuclease ABC, A subunit  43.51 
 
 		 945 aa  787    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  42.87 
 
 		 967 aa  770    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0746  excinuclease ABC, A subunit  43.88 
 
 		 940 aa  782    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0735  excinuclease ABC subunit A  44.46 
 
 		 964 aa  784    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0936204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0063  excinuclease ABC, A subunit  42.57 
 
 		 955 aa  764    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1527  excinuclease ABC, A subunit  42.57 
 
 		 955 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  45.96 
 
 		 931 aa  826    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  46.68 
 
 		 942 aa  815    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  44.33 
 
 		 934 aa  819    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0594  excinuclease ABC, A subunit  42.57 
 
 		 955 aa  764    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>