More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3333 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3333  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
301 aa  612  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4428  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.33 
 
 
301 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3523  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.8 
 
 
305 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.550375  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06555  S-adenosyl-methyltransferase mraW  57.91 
 
 
298 aa  346  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2748  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.05 
 
 
298 aa  345  6e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1803  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.9 
 
 
302 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.11 
 
 
304 aa  336  1.9999999999999998e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.148512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.19 
 
 
302 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0277587 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0908  hypothetical protein  50.33 
 
 
310 aa  294  1e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_002950  PG0573  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.39 
 
 
311 aa  264  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2708  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
327 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00108828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.28 
 
 
310 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.65 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.44 
 
 
310 aa  232  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.12 
 
 
310 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.67 
 
 
291 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.79 
 
 
310 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.79 
 
 
310 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.79 
 
 
310 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.79 
 
 
310 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.79 
 
 
310 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.97 
 
 
313 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.72 
 
 
306 aa  229  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.46 
 
 
310 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.79 
 
 
310 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.46 
 
 
310 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.79 
 
 
310 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.14 
 
 
310 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.14 
 
 
310 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.42 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0476  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00757887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.66 
 
 
313 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.66 
 
 
313 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.66 
 
 
313 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.66 
 
 
313 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.46 
 
 
307 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.34 
 
 
313 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  42.77 
 
 
313 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.77 
 
 
313 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.41 
 
 
315 aa  218  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.77 
 
 
313 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.77 
 
 
313 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  42.77 
 
 
313 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.77 
 
 
313 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.77 
 
 
313 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.94 
 
 
316 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.77 
 
 
313 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
316 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.77 
 
 
313 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.69 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 
318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.69 
 
 
313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.45 
 
 
313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.72 
 
 
310 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  43.42 
 
 
311 aa  215  9e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.37 
 
 
313 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.83 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.53 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.53 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.04 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.12 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000973738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.48 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1209  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.46 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.034127  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0559  methyltransferase  42.02 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.94 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.02 
 
 
310 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.17 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.26 
 
 
313 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.26 
 
 
313 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.26 
 
 
313 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.26 
 
 
313 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.26 
 
 
313 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.77 
 
 
308 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0945  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.77 
 
 
308 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2502  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.36 
 
 
316 aa  209  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.83 
 
 
313 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.51 
 
 
313 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.97 
 
 
308 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.53 
 
 
313 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0585  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 
318 aa  207  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.31 
 
 
308 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3788  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.21 
 
 
314 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.18 
 
 
314 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.81 
 
 
313 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.61 
 
 
307 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.91 
 
 
311 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.35 
 
 
313 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916249  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1997  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.95 
 
 
283 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.573092 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.29 
 
 
307 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.04 
 
 
313 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.03 
 
 
313 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2926  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.49 
 
 
320 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3526  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.49 
 
 
320 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.49 
 
 
320 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.48 
 
 
314 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.89 
 
 
294 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.38 
 
 
312 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1151  SAM-dependent methyltransferase for cell envelope biogenesis  39.68 
 
 
314 aa  201  9e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.07 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>