More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3053 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  52.41 
 
 		 1045 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  51.36 
 
 		 1046 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  53.03 
 
 		 1045 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2058  heavy metal efflux pump, CzcA family  53.5 
 
 		 1045 aa  694    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000624585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  52.55 
 
 		 1045 aa  692    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  53.32 
 
 		 1048 aa  683    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3053  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 645 aa  1301    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000102384  decreased coverage  0.000425378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2164  heavy metal efflux pump, CzcA family  53.03 
 
 		 1045 aa  678    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3079  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.01 
 
 		 1045 aa  678    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.931576  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  73.57 
 
 		 1049 aa  957    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  45.61 
 
 		 1043 aa  571  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4049  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.63 
 
 		 1079 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3976  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.63 
 
 		 1079 aa  565  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  43.56 
 
 		 1066 aa  561  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  43.67 
 
 		 1057 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0714  cation efflux system protein  42.7 
 
 		 1041 aa  556  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  44.98 
 
 		 1051 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  44.02 
 
 		 1043 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2183  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.76 
 
 		 1043 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  44.44 
 
 		 1059 aa  555  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  44.1 
 
 		 1069 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00320  cation efflux system protein CusA  42.81 
 
 		 1045 aa  549  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.665603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  44.83 
 
 		 1052 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  45.18 
 
 		 1044 aa  547  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  43.29 
 
 		 1040 aa  548  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  42.75 
 
 		 1052 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  44.55 
 
 		 1060 aa  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06366  hypothetical protein  42.9 
 
 		 1059 aa  542  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  44.59 
 
 		 1042 aa  545  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  44.59 
 
 		 1043 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2894  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.93 
 
 		 1045 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.577578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1603  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.73 
 
 		 1052 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3643  cation efflux system protein  44.03 
 
 		 1063 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  44.62 
 
 		 1058 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  45.75 
 
 		 1055 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0024  CzcA family heavy metal efflux protein  43.1 
 
 		 1052 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0473  CzcA family heavy metal efflux protein  44.46 
 
 		 1056 aa  538  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.39068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0022  CzcA family heavy metal efflux protein  43.1 
 
 		 1052 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6282  CzcA family heavy metal efflux protein  43.37 
 
 		 1068 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491237  normal  0.311834 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4833  CzcA family heavy metal efflux protein  44.7 
 
 		 1056 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  44.44 
 
 		 1058 aa  537  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1019  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.59 
 
 		 1054 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.797494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  43.46 
 
 		 1059 aa  538  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001395  cation efflux system protein cusA  42.36 
 
 		 1046 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0283098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0022  CzcA family heavy metal efflux protein  43.1 
 
 		 1052 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  45.96 
 
 		 1063 aa  537  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3075  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.53 
 
 		 1045 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1259  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.51 
 
 		 1045 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  44.79 
 
 		 1051 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  43.39 
 
 		 1039 aa  532  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  43.62 
 
 		 1055 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7981  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.43 
 
 		 1057 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3972  CzcA family heavy metal efflux protein  43.81 
 
 		 1057 aa  531  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  43.54 
 
 		 1068 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4114  CzcA family heavy metal efflux protein  43.7 
 
 		 1068 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1646  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.34 
 
 		 1055 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4112  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.35 
 
 		 1057 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3345  CzcA family heavy metal efflux protein  43.54 
 
 		 1068 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  43.54 
 
 		 1068 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5287  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.34 
 
 		 1055 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  44.14 
 
 		 1060 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  43.54 
 
 		 1068 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  42.31 
 
 		 1047 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.31 
 
 		 1047 aa  527  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0622  cation efflux system protein cusA  42.31 
 
 		 1047 aa  527  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00104736  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1809  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.99 
 
 		 1056 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.642799  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00525  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1047 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.746936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0593  cation efflux system protein cusA  42.47 
 
 		 1047 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3071  CzcA family heavy metal efflux protein  42.31 
 
 		 1047 aa  527  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9869  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.21 
 
 		 1053 aa  527  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1045  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.63 
 
 		 1049 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4591  CzcA family heavy metal efflux protein  42.77 
 
 		 1055 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5355  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.58 
 
 		 1056 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6299  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.97 
 
 		 1048 aa  528  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  44.55 
 
 		 1065 aa  528  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5686  CzcA family heavy metal efflux protein  43.37 
 
 		 1068 aa  528  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1109  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.33 
 
 		 1057 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36522  hitchhiker  0.00721325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2563  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.11 
 
 		 1054 aa  528  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725882 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0656  cation efflux system protein cusA  42.47 
 
 		 1045 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.146377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  43.14 
 
 		 1047 aa  525  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  40.66 
 
 		 1039 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0593  cation efflux system protein cusA  42.31 
 
 		 1047 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1165  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.21 
 
 		 1045 aa  525  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  43.15 
 
 		 1056 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  42.97 
 
 		 1045 aa  523  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  42.05 
 
 		 1049 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  41.67 
 
 		 1047 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4015  CzcA family heavy metal efflux protein  41.96 
 
 		 1050 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.310699  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3043  CzcA family heavy metal efflux protein  43 
 
 		 1048 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  40.47 
 
 		 1074 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3362  CzcA family heavy metal efflux protein  44.46 
 
 		 1039 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  43.99 
 
 		 1056 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  43.56 
 
 		 1056 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  43.19 
 
 		 1052 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0355  CzcA family heavy metal efflux protein  42.79 
 
 		 1044 aa  515  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3989  CzcA family heavy metal efflux protein  40.82 
 
 		 1045 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  41.71 
 
 		 1056 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  41.93 
 
 		 1039 aa  514  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3813  CzcA family heavy metal efflux protein  43.78 
 
 		 1059 aa  515  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271782 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3422  CzcA family heavy metal efflux protein  41.93 
 
 		 1048 aa  511  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.380989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>