More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1869 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1869  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
301 aa  619  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1868  cell wall hydrolase/autolysin  55 
 
 
281 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3635  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.86 
 
 
265 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0639  hypothetical protein  39.5 
 
 
261 aa  217  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6191  cell wall hydrolase/autolysin  41.52 
 
 
556 aa  205  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387817  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0750  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.2 
 
 
257 aa  199  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0156539  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4902  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.38 
 
 
282 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.579527  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1048  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.24 
 
 
396 aa  192  5e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1164  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase I  38.76 
 
 
265 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2112  cell wall hydrolase/autolysin  39.86 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0823125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4585  cell wall hydrolase/autolysin  37.37 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11083  putative exported N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 
370 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.395854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0812  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.14 
 
 
406 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0110  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.68 
 
 
592 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0076  cell wall hydrolase/autolysin  37.02 
 
 
574 aa  152  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2462  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.5 
 
 
556 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.82 
 
 
607 aa  143  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.17957  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2072  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.82 
 
 
567 aa  142  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2841  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.36 
 
 
575 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2211  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.35 
 
 
563 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0456  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.07 
 
 
659 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189951  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.07 
 
 
659 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.834523  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1285  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.07 
 
 
659 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0142  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.08 
 
 
603 aa  116  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.454848 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0650  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.46 
 
 
525 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2832  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.92 
 
 
644 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1381  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.19 
 
 
443 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0620  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.98 
 
 
646 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1425  cell wall hydrolase/autolysin  32.7 
 
 
423 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0357452  normal  0.827942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2409  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.53 
 
 
507 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262199  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2815  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.64 
 
 
506 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1153  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.87 
 
 
731 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2997  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.52 
 
 
789 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1127  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.57 
 
 
667 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1821  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.27 
 
 
419 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00645936  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.53 
 
 
604 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00690488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AMIC precursor protein  28.35 
 
 
507 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3444  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.07 
 
 
249 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.426518  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3508  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.07 
 
 
249 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1694  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
608 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.739566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3140  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  28.02 
 
 
419 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2161  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.08 
 
 
603 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.72441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2251  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.08 
 
 
603 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0506573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3362  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.07 
 
 
249 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0892  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.81 
 
 
568 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.105159  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0584  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.84 
 
 
499 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2573  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.47 
 
 
382 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1209  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
469 aa  99  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1144  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.73 
 
 
427 aa  99  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.54103  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0874  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2964  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  28 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2963  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  28 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3045  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  28 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02626  hypothetical protein  28 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3137  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  28 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4082  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  28 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354645  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0729  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.32 
 
 
484 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1374  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.82 
 
 
529 aa  97.4  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.736006  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3426  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
248 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1519  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.52 
 
 
418 aa  96.3  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113628  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0526  cell wall hydrolase/autolysin  26.64 
 
 
497 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3260  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.97 
 
 
417 aa  95.9  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2027  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.62 
 
 
454 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.91 
 
 
474 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.125384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1511  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.98 
 
 
577 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00018605  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0906  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.78 
 
 
405 aa  93.6  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3811  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.31 
 
 
417 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145796  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.16 
 
 
472 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0519  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.63 
 
 
515 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0664  cell wall hydrolase/autolysin  27.46 
 
 
339 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0493  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.52 
 
 
455 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3228  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.56 
 
 
416 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0709021  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0994  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.56 
 
 
416 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.367182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.27 
 
 
601 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419144  normal  0.116677 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0714  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.95 
 
 
355 aa  90.9  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.18 
 
 
508 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.095859  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0910  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.79 
 
 
518 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0486  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  30.8 
 
 
491 aa  90.5  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2016  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.54 
 
 
406 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0907  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.79 
 
 
518 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1952  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.18 
 
 
503 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370807  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1752  cell wall hydrolase/autolysin  28.96 
 
 
419 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000020425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2563  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.18 
 
 
504 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0770  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.4 
 
 
338 aa  90.5  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00128935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.79 
 
 
514 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, AMIC precursor protein  28.79 
 
 
514 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2385  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.83 
 
 
458 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.282435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2500  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.79 
 
 
514 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.79 
 
 
514 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.292024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0722  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.4 
 
 
514 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1046  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.16 
 
 
416 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0326494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3277  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.91 
 
 
484 aa  89.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.131328  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2421  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.85 
 
 
309 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0843  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28 
 
 
399 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.807823  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1783  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.74 
 
 
465 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0746  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.24 
 
 
522 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.63 
 
 
746 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.53 
 
 
448 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>