17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1697 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1697  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  964    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.472344  normal  0.0751505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0048  hypothetical protein  60.7 
 
 
465 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883134  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4485  putative oxidoreductase  61.79 
 
 
461 aa  588  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1024  hypothetical protein  50.22 
 
 
464 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  22.83 
 
 
474 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  23.29 
 
 
327 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  22.67 
 
 
495 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  19.63 
 
 
342 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  22.7 
 
 
450 aa  48.5  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  22.64 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  22.46 
 
 
470 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  22.73 
 
 
699 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  23.08 
 
 
421 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  23.23 
 
 
425 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  22.58 
 
 
435 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  21.08 
 
 
467 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>