83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1608 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1608  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 700 aa  1415    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0916  hypothetical protein  29.01 
 
 		 543 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  61.36 
 
 		 1026 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  55.1 
 
 		 1164 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  43.33 
 
 		 1096 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  34.71 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 540 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 499 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1060 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 1055 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  48.98 
 
 		 1083 aa  53.9  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 486 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  38.98 
 
 		 1011 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.94 
 
 		 507 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 494 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 557 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 506 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  36.13 
 
 		 478 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 477 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  33.59 
 
 		 511 aa  52  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 513 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  46.94 
 
 		 1079 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 483 aa  50.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  27.52 
 
 		 135 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  30.33 
 
 		 494 aa  50.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 1020 aa  49.3  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1049 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  30.5 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  38.1 
 
 		 1036 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  40.35 
 
 		 1033 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  38.2 
 
 		 1023 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  52.38 
 
 		 1006 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  25.75 
 
 		 511 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  45.61 
 
 		 1128 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  44.9 
 
 		 1077 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  32.03 
 
 		 194 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  35.77 
 
 		 487 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 561 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.23 
 
 		 494 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  22.95 
 
 		 466 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 531 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  37.18 
 
 		 1065 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1012 aa  47.8  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  29.63 
 
 		 504 aa  47.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 486 aa  47.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 582 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  40.82 
 
 		 1155 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 493 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 451 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  39.68 
 
 		 1130 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  44.68 
 
 		 1020 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 		 929 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1071 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 1050 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 1047 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  24.86 
 
 		 476 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  40.82 
 
 		 1003 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  29.06 
 
 		 502 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 539 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 1071 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 481 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  31 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  32.84 
 
 		 508 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1116 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  22.32 
 
 		 1066 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  40 
 
 		 1002 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1021 aa  45.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  24.36 
 
 		 499 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 549 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 452 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  37.25 
 
 		 1177 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  43.75 
 
 		 1038 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 601 aa  44.3  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1094 aa  44.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  30.72 
 
 		 193 aa  44.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 506 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 1189 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  31.03 
 
 		 498 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.91 
 
 		 490 aa  44.3  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  44.19 
 
 		 1029 aa  43.9  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 584 aa  43.9  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1004 aa  43.9  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  26.22 
 
 		 507 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>