31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0591 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0591  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  495  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0070  hypothetical protein  28.16 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1933  hypothetical protein  27.12 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0367  hypothetical protein  25.82 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  33.04 
 
 		 1018 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1023 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1059 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 986 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1037 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1041 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1040 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1136 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 994 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1023 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  37.38 
 
 		 1064 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0578  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 903 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1036 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 1033 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0278  secreted protein  30.23 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000164081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 999 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1134 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 1154 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1004 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1175 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 1093 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1113 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 1144 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1094 aa  42  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 874 aa  42  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  28 
 
 		 709 aa  42  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1052 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>