57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0072 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0072  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  100 
 
 		 226 aa  470  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1913  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.63 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1782  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  30.08 
 
 		 300 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0071  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.69 
 
 		 303 aa  108  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.616993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00645  hemagglutinin  36.23 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1112  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  40.77 
 
 		 175 aa  95.5  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0852856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  34.84 
 
 		 619 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1218  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  33.12 
 
 		 176 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000241377 
 
 
-
 
NC_002950  PG0076  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.91 
 
 		 313 aa  89  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2771  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  26.51 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.8 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1448  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.87 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000283745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2235  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.74 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070926 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1247  muramidase (flagellum-specific)  30.41 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0424705  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1812  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.12 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0555239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3400  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25.32 
 
 		 157 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1517  N-acetylmuramidase  29.49 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284159  normal  0.409948 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.66 
 
 		 655 aa  48.5  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  25.32 
 
 		 361 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.3 
 
 		 619 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.3 
 
 		 619 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  41.79 
 
 		 324 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0470  aminodeoxychorismate lyase  26.14 
 
 		 433 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.643443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2726  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.6 
 
 		 348 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000204144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  45.71 
 
 		 647 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  32.35 
 
 		 310 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1472  peptidoglycan hydrolase  28.03 
 
 		 170 aa  45.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  hitchhiker  0.0020781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  31.71 
 
 		 304 aa  45.4  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  47.83 
 
 		 451 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 733 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.33 
 
 		 353 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.68 
 
 		 474 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  28.08 
 
 		 390 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  54.35 
 
 		 483 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  54.35 
 
 		 483 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 		 618 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  54.35 
 
 		 483 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06162  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.39 
 
 		 392 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01004  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.39 
 
 		 392 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  54.35 
 
 		 483 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  48.89 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  43.64 
 
 		 429 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  48.89 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  47.73 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0564  N-acetylmuramidase  29.05 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000047381  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 527 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 289 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  23.29 
 
 		 379 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.19 
 
 		 361 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  56.82 
 
 		 633 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.19 
 
 		 361 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 444 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  43.64 
 
 		 448 aa  42.4  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  52.17 
 
 		 477 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1898  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.03 
 
 		 399 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  52.38 
 
 		 509 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  28.15 
 
 		 288 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>