27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0070 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0070  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0367  hypothetical protein  30.09 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0591  hypothetical protein  30.67 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1933  hypothetical protein  24.89 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4195  hypothetical protein  27.32 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0266  hypothetical protein  25.2 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  0.0704311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0278  secreted protein  22.86 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000164081  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08806  hypothetical protein  24.07 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115888  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 1033 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2401  hypothetical protein  25.88 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1120 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6188  hypothetical protein  24.46 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.19766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 994 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1117 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 1154 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 924 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  28.46 
 
 		 709 aa  45.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1033 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  33.96 
 
 		 1009 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  30.19 
 
 		 1030 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1033 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1006 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1034 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1219 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  29.52 
 
 		 1035 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  28.81 
 
 		 1018 aa  42.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 947 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>