43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4437 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4437  H-NS family protein MvaT  100 
 
 
125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00708385  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4019  transcriptional regulator, putative  90.48 
 
 
126 aa  227  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000036562  normal  0.0246266 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_4315  transcriptional regulator, putative  90.48 
 
 
126 aa  227  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000286205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1006  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  91.2 
 
 
125 aa  224  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000105934  hitchhiker  0.0000000000004027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4448  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  91.2 
 
 
125 aa  224  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000222895  hitchhiker  0.00000983981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4357  hypothetical protein  90.4 
 
 
125 aa  223  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.00000000000135149  normal  0.0272701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1366  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  90.4 
 
 
125 aa  222  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000478135  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3313  H-NS family protein MvaT  88.1 
 
 
134 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.724808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38310  Transcriptional regulator MvaT  78.4 
 
 
126 aa  193  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0396822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4883  transcriptional regulator MvaT  76 
 
 
125 aa  190  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56070  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  77.78 
 
 
124 aa  189  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0979321  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4794  hypothetical protein  52.5 
 
 
122 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3103  transcriptional regulator, putative  54.92 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000951367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2443  hypothetical protein  54.1 
 
 
120 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0503835  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4755  hypothetical protein  53.23 
 
 
124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3014  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  127  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2971  transcriptional regulator, putative  54.1 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0855395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3693  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  52.07 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  decreased coverage  0.000194447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4167  hypothetical protein  49.17 
 
 
119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189495  normal  0.273328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2345  hypothetical protein  49.18 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1634  hypothetical protein  56.56 
 
 
138 aa  123  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0882393  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2947  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  50.82 
 
 
123 aa  121  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194319  normal  0.217791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5037  hypothetical protein  47.5 
 
 
121 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.038586  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2102  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  51.67 
 
 
119 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.313756  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2138  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  50.83 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000737433  hitchhiker  0.00000269456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1652  H-NS family protein MvaT  47.5 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3765  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  50 
 
 
119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2795  H-NS family protein MvaT  49.17 
 
 
121 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289356  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1998  hypothetical protein  48.76 
 
 
134 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.989293  hitchhiker  0.000130496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2532  hypothetical protein  47.5 
 
 
117 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2921  H-NS family protein MvaT  49.17 
 
 
121 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0220889  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0128  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29590  putative transcriptional regulator  49.17 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.656804  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0009  hypothetical protein  46.67 
 
 
119 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0017  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  46.67 
 
 
119 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499101  unclonable  0.000000189493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0011  hypothetical protein  46.67 
 
 
119 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570728  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0009  hypothetical protein  46.67 
 
 
119 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000754026  normal  0.103636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0281  hypothetical protein  48.33 
 
 
121 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2608  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  45.45 
 
 
122 aa  110  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000264068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3337  transcriptional regulator, putative  44.17 
 
 
121 aa  103  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2960  hypothetical protein  45.83 
 
 
121 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437612  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4162  hypothetical protein  49.06 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4154  hypothetical protein  41.67 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>