24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3832 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3832  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.573259  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1322  putative lipoprotein  31.12 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00089684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3012  putative lipoprotein  31.86 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000028974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2845  putative lipoprotein  29.06 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3007  putative lipoprotein  25.35 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2521  putative lipoprotein  24.35 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2861  putative lipoprotein  23.81 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000231875  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1407  putative lipoprotein  25.58 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1342  putative lipoprotein  25.58 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3157  putative lipoprotein  25.7 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1395  putative lipoprotein  23.41 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.19041  normal  0.0366327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3202  hypothetical protein  23.79 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.210249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1102  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  23.08 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00996  hypothetical protein  23.08 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1222  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  23.08 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000233631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2329  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  23.08 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2610  putative regulator  23.08 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.283606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00989  predicted outer membrane lipoprotein  23.08 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1096  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  23.08 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2657  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  23.08 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4003  hypothetical protein  24.88 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.401316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03859  hypothetical protein  24.88 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03899  predicted lipoprotein  24.88 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00051  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0750623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>