21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3056 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3056  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
145 aa  296  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.708736  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  88.71 
 
 
125 aa  228  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0764  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.11 
 
 
122 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00475722  hitchhiker  0.0000687435 
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_5360  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.3 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000102648  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3440  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.66 
 
 
122 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000008426  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4927  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.66 
 
 
122 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111834  normal  0.0525996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4876  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.11 
 
 
122 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000210055  hitchhiker  0.00000000162299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4359  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.11 
 
 
122 aa  169  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189574  unclonable  0.00000450981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1850  hypothetical protein  53.78 
 
 
164 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0857051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2213  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.59 
 
 
123 aa  124  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.739049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5372  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.75 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274655  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2800  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
269 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000207349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3150  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.87 
 
 
98 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1430  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.14 
 
 
111 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0769988  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1914  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1960  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03224  pyruvate dehydrogenase complex, E2 component, dihydrolipoamide acetyltransferase  26.61 
 
 
679 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2527  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.33 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00497835  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531234  normal  0.0179673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>