297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2512 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2201  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.23 
 
 		 478 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00427716  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1618  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  77.49 
 
 		 474 aa  763    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4250  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  77.49 
 
 		 474 aa  763    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4255  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  81.22 
 
 		 480 aa  805    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0453  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.84 
 
 		 480 aa  685    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.922197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2604  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  79.75 
 
 		 480 aa  795    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000152837  normal  0.741537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1276  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  70.99 
 
 		 485 aa  675    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2211  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  70.93 
 
 		 475 aa  709    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1995  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  68.51 
 
 		 474 aa  690    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.833948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3573  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  80.8 
 
 		 480 aa  802    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2364  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.7 
 
 		 478 aa  720    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2004  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  79.61 
 
 		 480 aa  767    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1563  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.3 
 
 		 476 aa  705    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1053  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.52 
 
 		 477 aa  693    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0569715  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3413  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  77.05 
 
 		 480 aa  765    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0737361 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0778  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.83 
 
 		 493 aa  640    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0713  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.85 
 
 		 475 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000329894  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1613  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  81.22 
 
 		 480 aa  805    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00989974  hitchhiker  0.00775448 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.32 
 
 		 482 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2425  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.85 
 
 		 474 aa  706    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408104  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0643  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  69.96 
 
 		 473 aa  684    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000439174  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3773  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  78.11 
 
 		 475 aa  773    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1363  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.62 
 
 		 491 aa  684    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.41805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3820  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  81.01 
 
 		 480 aa  804    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2599  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  76.32 
 
 		 479 aa  756    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00049011  normal  0.717457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1523  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.65 
 
 		 479 aa  683    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1823  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  81.26 
 
 		 480 aa  798    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1827  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  77.59 
 
 		 474 aa  775    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2512  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 475 aa  961    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1791  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.28 
 
 		 478 aa  717    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398025  normal  0.231358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3569  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  77.07 
 
 		 474 aa  761    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3816  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  77.71 
 
 		 474 aa  763    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2214  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.23 
 
 		 478 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000199184  normal  0.656675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2779  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.03 
 
 		 479 aa  659    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2478  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.24 
 
 		 480 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02303  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.51 
 
 		 477 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0958  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  83.15 
 
 		 475 aa  809    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0979649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1277  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.32 
 
 		 476 aa  666    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552433  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1197  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.37 
 
 		 485 aa  702    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3436  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  77.46 
 
 		 480 aa  746    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1000  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.51 
 
 		 479 aa  661    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3782  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  68.67 
 
 		 478 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20010  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  79.75 
 
 		 480 aa  795    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1930  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.18 
 
 		 478 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000131874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2220  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.23 
 
 		 478 aa  719    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00351736  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1959  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.89 
 
 		 478 aa  721    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0873293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2422  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.98 
 
 		 490 aa  689    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.505766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1104  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.37 
 
 		 485 aa  702    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0460465  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2170  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.23 
 
 		 478 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00937158  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02054  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  70.76 
 
 		 477 aa  710    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.02911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4305  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.11 
 
 		 477 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0405155  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1851  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.02 
 
 		 477 aa  711    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000190326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003467  cytochrome c oxidase subunit CcoN  71.3 
 
 		 475 aa  708    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0631  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.28 
 
 		 472 aa  694    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1084  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.51 
 
 		 479 aa  661    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1784  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  74.47 
 
 		 476 aa  737    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0784  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.99 
 
 		 493 aa  643    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2044  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.76 
 
 		 482 aa  682    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0265889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2214  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.15 
 
 		 478 aa  707    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000208976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2073  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.96 
 
 		 479 aa  697    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0157886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1744  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.77 
 
 		 496 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2818  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  66.45 
 
 		 479 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1170  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.13 
 
 		 486 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3777  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  80.84 
 
 		 475 aa  795    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2775  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  70 
 
 		 478 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.605339 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2006  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.7 
 
 		 478 aa  720    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00103508  hitchhiker  0.0000000337866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1969  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.7 
 
 		 478 aa  720    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00116918  normal  0.0108998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1985  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.8 
 
 		 475 aa  717    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1882  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  73.87 
 
 		 474 aa  706    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.746133 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0939  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  69.7 
 
 		 482 aa  706    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2010  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.61 
 
 		 475 aa  721    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000523358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10500  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  83.37 
 
 		 475 aa  811    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40510  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  77.46 
 
 		 480 aa  744    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44340  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  78.11 
 
 		 475 aa  773    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44370  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  81.05 
 
 		 475 aa  796    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2107  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.7 
 
 		 478 aa  720    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000291531  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4487  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.23 
 
 		 478 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0338  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.12 
 
 		 484 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0297011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0629  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.21 
 
 		 485 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2353  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.96 
 
 		 472 aa  605  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000365597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1676  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.13 
 
 		 552 aa  593  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0158  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  60.92 
 
 		 495 aa  584  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.363228 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4962  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.62 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3000  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.09 
 
 		 496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0591739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0363  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.69 
 
 		 541 aa  580  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1532  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  61.81 
 
 		 563 aa  580  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2578  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.03 
 
 		 548 aa  579  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2792  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.83 
 
 		 539 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0469  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.8 
 
 		 541 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222667  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5935  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.77 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6268  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.77 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3332  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260717  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1880  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  61.26 
 
 		 486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152701  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2545  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.92 
 
 		 534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.199988  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2092  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.74 
 
 		 549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196444  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0379  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.25 
 
 		 541 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3270  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.94 
 
 		 552 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216539  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2351  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.92 
 
 		 535 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0015  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  59.52 
 
 		 550 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0459  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  59.78 
 
 		 555 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306699  normal  0.0526078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>