37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0028 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0028  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0080  hypothetical protein  49.77 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0095  hypothetical protein  49.07 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0098  hypothetical protein  43.98 
 
 		 182 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000660133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0095  hypothetical protein  42.01 
 
 		 184 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000456218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36450  hypothetical protein  38.86 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00361093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3127  hypothetical protein  36.49 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  30.49 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  27.88 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  29.69 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  30.65 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  27.31 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  31.36 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 		 348 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  31.58 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 309 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  27.65 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  30.85 
 
 		 295 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  27.38 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3376  NmrA family protein  27.85 
 
 		 513 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388935  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 223 aa  42  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  27.22 
 
 		 211 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 214 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  27.93 
 
 		 216 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>