295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_R0012 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_R0012  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0004  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.843382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0064  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.050836  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0004  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0280909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0081  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0094  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0100  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0076  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0013  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.843481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0092  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0031  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.693332  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0075  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0097  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0084  5S ribosomal RNA  99.13 
 
 		 115 bp  220  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0009  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 		 115 bp  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0097  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 		 115 bp  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00001198  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0073  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 		 115 bp  216  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0019  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 		 115 bp  216  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0077  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 		 115 bp  216  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.917168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0074  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 		 115 bp  216  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0058  5S ribosomal RNA  98.26 
 
 		 115 bp  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0005  5S ribosomal RNA  98.26 
 
 		 115 bp  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0092  5S ribosomal RNA  98.26 
 
 		 115 bp  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0023  5S ribosomal RNA  98.26 
 
 		 115 bp  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0739935  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0084  5S ribosomal RNA  98.26 
 
 		 115 bp  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0097  5S ribosomal RNA  98.26 
 
 		 115 bp  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0900982  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0016  5S ribosomal RNA  98.26 
 
 		 115 bp  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0091  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 		 115 bp  210  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0085  5S ribosomal RNA  98.23 
 
 		 115 bp  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00283283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0011  5S ribosomal RNA  98.23 
 
 		 115 bp  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0025  5S ribosomal RNA  98.21 
 
 		 115 bp  206  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0010  5S ribosomal RNA  97.39 
 
 		 127 bp  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.504434  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0023  5S ribosomal RNA  97.39 
 
 		 124 bp  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.425575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0065  5S ribosomal RNA  97.39 
 
 		 127 bp  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.453414  hitchhiker  0.00940603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0085  5S ribosomal RNA  97.39 
 
 		 124 bp  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.930592  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0089  5S ribosomal RNA  97.39 
 
 		 127 bp  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00155653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0100  5S ribosomal RNA  97.39 
 
 		 124 bp  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0103475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0105  5S ribosomal RNA  97.39 
 
 		 127 bp  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0062634  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0034  5S ribosomal RNA  97.39 
 
 		 115 bp  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0083  5S ribosomal RNA  97.32 
 
 		 132 bp  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.192936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00003  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0784368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00004  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00008  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00013  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.556754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00016  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00019  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00022  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.202347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0007  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0030  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00223295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0074  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0087  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0110  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0110  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0386945  hitchhiker  0.00613007 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0087  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0009  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.262282  normal  0.189005 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0034  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0258342  hitchhiker  0.00258348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0127  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0628254  normal  0.0472404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0116  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663051  hitchhiker  0.0000514777 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0102  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 115 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5095  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000125825  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5007  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5053  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.682071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5084  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.478854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5074  5S ribosomal RNA  96.52 
 
 		 120 bp  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0500147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5436  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100439  normal  0.0308704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4516  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4128  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0828263  normal  0.309773 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2869  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.546434  normal  0.503034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3661  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4273  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4177  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4380  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5295  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.380425  normal  0.83717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2767  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.906471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0297  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4469  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000249854  hitchhiker  0.000000000300511 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3569  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802154  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2741  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4419  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000753188  hitchhiker  0.00225378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0199  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4462  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256702  hitchhiker  0.00629285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4236  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00109899  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0219  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0482781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4325  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.806552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4109  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3054  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4465  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.824803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4913  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.323057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4504  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0280435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4544  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00145539  hitchhiker  0.00000000150257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4589  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0278  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2984  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4105  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4761  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4734  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.01834  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4120  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4223  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4379  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383552  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4426  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 116 bp  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.548892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>