28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2859 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2859  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  314  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000499435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2550  hypothetical protein  95.36 
 
 
152 aa  295  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000402776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1599  hypothetical protein  86.18 
 
 
157 aa  276  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000141741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1565  hypothetical protein  83.66 
 
 
153 aa  264  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1753  hypothetical protein  81.58 
 
 
152 aa  253  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137665  decreased coverage  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1944  hypothetical protein  81.08 
 
 
164 aa  243  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000019157  normal  0.132767 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2632  hypothetical protein  81.08 
 
 
151 aa  243  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000555352  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2544  hypothetical protein  81.08 
 
 
151 aa  243  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.10259e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1110  hypothetical protein  78.67 
 
 
150 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.00310953 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1178  hypothetical protein  78.67 
 
 
150 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000328612  normal  0.811815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1132  hypothetical protein  78.67 
 
 
150 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000320725  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1027  hypothetical protein  78.67 
 
 
150 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000404614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1144  hypothetical protein  78.67 
 
 
150 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000646309  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2164  hypothetical protein  78.38 
 
 
150 aa  236  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275676  normal  0.229611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1065  hypothetical protein  78.38 
 
 
150 aa  236  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.95489e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2640  hypothetical protein  78.38 
 
 
150 aa  236  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000830726  hitchhiker  0.000000341922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00960  hypothetical protein  78.38 
 
 
150 aa  236  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000190076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00967  hypothetical protein  78.38 
 
 
150 aa  236  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000351017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1120  hypothetical protein  78.38 
 
 
150 aa  236  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.906723 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2687  protein of unknown function DUF1047  78.38 
 
 
150 aa  236  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1468  hypothetical protein  76.16 
 
 
151 aa  235  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000258069  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1070  hypothetical protein  77.7 
 
 
150 aa  234  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010913  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2360  hypothetical protein  77.7 
 
 
150 aa  233  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.93337e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02330  hypothetical protein  54.36 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1558  hypothetical protein  56.46 
 
 
148 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00564355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003445  hypothetical protein  53.69 
 
 
149 aa  168  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000947124  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1089  hypothetical protein  51.7 
 
 
169 aa  159  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0857  hypothetical protein  51.02 
 
 
148 aa  149  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000117366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>