More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1555 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2686  sulphate transporter  94.79 
 
 
526 aa  908    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1555  sulphate transporter  100 
 
 
499 aa  994    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0072  sulphate transporter  66.6 
 
 
499 aa  629  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24520  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  66.11 
 
 
491 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.624226  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0078  sulphate transporter  53.72 
 
 
506 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.566328  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0902  sulphate transporter  54.69 
 
 
496 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2789  sulphate transporter  66.11 
 
 
415 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.556821  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1631  sulphate transporter  53.73 
 
 
499 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0896  sulphate transporter  54.83 
 
 
496 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1646  sulphate transporter  53.57 
 
 
527 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0415983  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0913  sulphate transporter  54.83 
 
 
496 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.846691  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4306  sulphate transporter  55.53 
 
 
502 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0228312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1159  sulphate transporter  54.41 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.778389  normal  0.502681 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21570  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  53.32 
 
 
505 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4351  sulphate transporter  53.33 
 
 
496 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05020  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  53.12 
 
 
520 aa  474  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0104  sulphate transporter  50.7 
 
 
500 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35810  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  54.38 
 
 
531 aa  458  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3144  sulphate transporter  52.72 
 
 
501 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0555  sulphate transporter  48.54 
 
 
497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0471  sulphate transporter  52.45 
 
 
542 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0142  sulphate transporter  51.61 
 
 
507 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  46.14 
 
 
487 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0735  sulphate transporter  49.68 
 
 
554 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725862  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3487  sulphate transporter  46.42 
 
 
496 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5170  sulphate transporter  47.68 
 
 
495 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  45.3 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3975  sulphate transporter  48.29 
 
 
526 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0019  sulphate transporter  44.82 
 
 
514 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4472  sulfate transporter  43.86 
 
 
492 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0760011  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4600  sulfate transporter  43.86 
 
 
492 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000140835  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  44.44 
 
 
483 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  43.7 
 
 
499 aa  397  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  45.13 
 
 
502 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  44.73 
 
 
495 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  44.68 
 
 
495 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3344  sulphate transporter  46.28 
 
 
496 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0024  sulfate permease family protein  44.33 
 
 
483 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  43.58 
 
 
500 aa  391  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  42.09 
 
 
483 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2764  sulphate transporter  43.5 
 
 
499 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2773  sulphate transporter  45.84 
 
 
499 aa  389  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0780  sulphate transporter  44.87 
 
 
494 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0945  sulfate transporter  45.03 
 
 
495 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0235468  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  42.48 
 
 
499 aa  388  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  43.88 
 
 
496 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1853  sulphate transporter  44.28 
 
 
496 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.770429  hitchhiker  0.00215909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0815  sulphate transporter  45.3 
 
 
484 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2483  sulphate transporter  46.15 
 
 
488 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0427  sulphate transporter  44.18 
 
 
493 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  41.67 
 
 
483 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4197  antisigma-factor antagonist, STAS  43.83 
 
 
496 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3036  sulphate transporter  44.89 
 
 
496 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0431  sulphate transporter  43.46 
 
 
494 aa  380  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0215713  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4143  sulphate transporter  45.32 
 
 
496 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508442  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0183  putative sulfate transporter  43.67 
 
 
495 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4257  antisigma-factor antagonist STAS  45.11 
 
 
496 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31380  putative sulfate transporter  43.67 
 
 
495 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114535  hitchhiker  0.000000000000146923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0226  sulphate transporter  44.75 
 
 
484 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660997  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0721  sulfate permease family protein  41.67 
 
 
483 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2639  sulphate transporter  44.16 
 
 
502 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4067  sulphate transporter  42.95 
 
 
502 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124032  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2102  sulphate transporter  45.36 
 
 
495 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4611  sulphate transporter  44.66 
 
 
493 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0782  sulfate permease family protein  41.45 
 
 
483 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1911  sulphate transporter  45.13 
 
 
497 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0621  sulfate permease family protein  41.24 
 
 
483 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.822382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0564  sulfate transporter  41.45 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0031948  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3460  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 
496 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.833239  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0710  sulfate permease family protein  41.45 
 
 
483 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.152209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0653  sulfate permease family protein  41.24 
 
 
483 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0567  sulphate transporter  41.61 
 
 
492 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2191  sulphate transporter  44.4 
 
 
488 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000878585  normal  0.36183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2719  sulphate transporter  45.76 
 
 
497 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.400715 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0565  sulfate transporter  41.24 
 
 
483 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02670  hypothetical protein  41.11 
 
 
496 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0374  sulphate transporter  44.99 
 
 
498 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5890  sulfate permease  43.8 
 
 
493 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1049  sulphate transporter  45.44 
 
 
500 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.272014  hitchhiker  0.000191113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3936  sulphate transporter  45.09 
 
 
501 aa  362  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.529754  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3643  sulphate transporter  45.09 
 
 
501 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3926  sulphate transporter  44.66 
 
 
492 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0884886  normal  0.213644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3234  sulfate permease family protein  42.83 
 
 
495 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2784  sulphate transporter  43.23 
 
 
494 aa  356  6.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  0.423283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1995  sulphate transporter  44.09 
 
 
496 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0186  sulphate transporter  44.09 
 
 
496 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1264  sulphate transporter  42.58 
 
 
492 aa  355  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.036153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3086  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  42.62 
 
 
495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1226  sulphate transporter  43.46 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0790  sulphate transporter  43.91 
 
 
496 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3083  sulphate transporter  44.4 
 
 
498 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0982983  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14611  putative sulfate transporter  40.94 
 
 
514 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.324968  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0631  putative sulfate transporter  40.73 
 
 
527 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0644  putative sulfate transporter  40.16 
 
 
521 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04150  sulfate permease  44.16 
 
 
495 aa  339  8e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0845  putative sulfate transporter  39.68 
 
 
523 aa  339  9e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1810  putative sulfate transporter  39.27 
 
 
520 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07001  putative sulfate transporter  39.56 
 
 
521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06711  putative sulfate transporter  40.36 
 
 
521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3392  sulphate transporter  43.07 
 
 
487 aa  333  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.106782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>