98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1268 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3732  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  84.51 
 
 
1512 bp  1110    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000579162  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0409  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  81.06 
 
 
1548 bp  733    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000774513  decreased coverage  0.00000719153 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1169  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  84.59 
 
 
1467 bp  1110    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00303448  normal  0.0122291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2657  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  84.1 
 
 
1536 bp  1063    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000195261  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2883  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  84.59 
 
 
1467 bp  1110    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3596  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  84.88 
 
 
1464 bp  1146    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000202307  normal  0.660698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2704  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  83.23 
 
 
1467 bp  938    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139604  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2767  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  83.42 
 
 
1467 bp  975    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268112  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2745  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  83.42 
 
 
1467 bp  975    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00565207  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2660  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  83.3 
 
 
1467 bp  946    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000716462  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2876  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  83.3 
 
 
1467 bp  946    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112732  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2792  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  84.52 
 
 
1467 bp  1102    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2659  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  84.59 
 
 
1467 bp  1110    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2729  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  83.31 
 
 
1464 bp  959    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0179443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02362  hypothetical protein  84.25 
 
 
1467 bp  1070    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00275672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1127  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  83.73 
 
 
1464 bp  924    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00407073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3004  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.64 
 
 
1467 bp  2052    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00999222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1268    100 
 
 
1603 bp  3178    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00784305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  82.28 
 
 
1467 bp  825    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02400  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  84.25 
 
 
1467 bp  1070    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00346378  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1160  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  84.25 
 
 
1467 bp  1070    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000565668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1302  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.85 
 
 
1464 bp  622  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000015836  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.85 
 
 
1464 bp  622  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  81.18 
 
 
1467 bp  174  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.59 
 
 
1473 bp  165  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.86 
 
 
1467 bp  163  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.52 
 
 
1467 bp  151  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  85.47 
 
 
1470 bp  149  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.05 
 
 
1467 bp  149  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  79.79 
 
 
1467 bp  147  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.06 
 
 
1467 bp  143  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  80.42 
 
 
1467 bp  143  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01076  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.3 
 
 
1464 bp  141  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  83.25 
 
 
1464 bp  137  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  79.94 
 
 
1467 bp  135  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  79.56 
 
 
1467 bp  131  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  79.36 
 
 
1467 bp  119  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  82.04 
 
 
1467 bp  115  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1269  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  83.03 
 
 
1467 bp  105  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000336634  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3124  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  83.44 
 
 
1473 bp  101  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119862  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  82.04 
 
 
1470 bp  93.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.31 
 
 
1467 bp  89.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  79.44 
 
 
1464 bp  87.7  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1913  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  87.95 
 
 
1461 bp  85.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1031  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  94.12 
 
 
1470 bp  77.8  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  94 
 
 
1470 bp  75.8  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  89.23 
 
 
1470 bp  73.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0651  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  84.78 
 
 
1458 bp  71.9  0.0000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  79.79 
 
 
1473 bp  71.9  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  86.25 
 
 
1461 bp  71.9  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2950  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  79.89 
 
 
1467 bp  69.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645163  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4588  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.16 
 
 
1470 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1014  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  85.06 
 
 
1467 bp  69.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  95.12 
 
 
1461 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  95.12 
 
 
1470 bp  65.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  85.92 
 
 
1500 bp  61.9  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1899  IMP dehydrogenase/GMP reductase  87.3 
 
 
1554 bp  61.9  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  85.14 
 
 
1464 bp  60  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  81.82 
 
 
1467 bp  60  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.68 
 
 
1461 bp  58  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1029  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.68 
 
 
1470 bp  58  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  92.68 
 
 
1599 bp  58  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  85.51 
 
 
1452 bp  58  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  83.33 
 
 
1449 bp  56  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  83.75 
 
 
1464 bp  56  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  90.91 
 
 
1464 bp  56  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  85.29 
 
 
1470 bp  56  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  90.91 
 
 
1473 bp  56  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4441  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  88.46 
 
 
1473 bp  56  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3123  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  88.46 
 
 
1533 bp  56  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1670  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  94.29 
 
 
1458 bp  54  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  80.87 
 
 
1470 bp  54  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  94.29 
 
 
1470 bp  54  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  83.78 
 
 
1476 bp  52  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  90.48 
 
 
1488 bp  52  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1346  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  85.48 
 
 
1470 bp  52  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15310  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  85.48 
 
 
1470 bp  52  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.10306  hitchhiker  4.2499e-17 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02973  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  83.33 
 
 
1341 bp  52  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.64339  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  83.12 
 
 
1461 bp  50.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1453  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  84.62 
 
 
1461 bp  50.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.136087  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  90.24 
 
 
1671 bp  50.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  84.62 
 
 
1464 bp  50.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  86.79 
 
 
1473 bp  50.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1777  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  84.62 
 
 
1461 bp  50.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.814385  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0730  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  82.35 
 
 
1470 bp  50.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  82.72 
 
 
1461 bp  50.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1285  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  90.24 
 
 
1461 bp  50.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0259426  normal  0.434243 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  90 
 
 
1473 bp  48.1  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  85 
 
 
1449 bp  48.1  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0196  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  87.5 
 
 
1473 bp  48.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4242  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  82.5 
 
 
1473 bp  48.1  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953996  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  93.75 
 
 
1473 bp  48.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1449  inosine-5-monophosphate dehydrogenase  90 
 
 
1470 bp  48.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327774  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  91.67 
 
 
1464 bp  48.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  93.75 
 
 
1461 bp  48.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  85.71 
 
 
1461 bp  48.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  84.38 
 
 
1497 bp  48.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  84.38 
 
 
1497 bp  48.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>