133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0263 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  82.76 
 
 		 1044 bp  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  82.76 
 
 		 1044 bp  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0263    100 
 
 		 1120 bp  2220    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000154526  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  83.99 
 
 		 1044 bp  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  93.39 
 
 		 1044 bp  1522    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  84.67 
 
 		 1044 bp  795    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  83.7 
 
 		 1044 bp  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  83.89 
 
 		 1044 bp  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  83.89 
 
 		 1044 bp  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  83.22 
 
 		 1044 bp  680    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  83.89 
 
 		 1044 bp  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  83.51 
 
 		 1044 bp  700    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  83.41 
 
 		 1044 bp  692    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  82.76 
 
 		 1044 bp  642    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  84.38 
 
 		 1044 bp  771    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  82.76 
 
 		 1044 bp  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1198    83.51 
 
 		 1044 bp  700    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000543988  hitchhiker  0.00888609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  83.41 
 
 		 1044 bp  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  82.76 
 
 		 1044 bp  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  82.95 
 
 		 1044 bp  658    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  82.66 
 
 		 1044 bp  634  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  82.66 
 
 		 1044 bp  634  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  82.66 
 
 		 1044 bp  634  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0483  rod shape-determining protein MreB  79.57 
 
 		 1044 bp  285  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  79.23 
 
 		 1050 bp  285  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000395514  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  81.65 
 
 		 1044 bp  256  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  80.66 
 
 		 1050 bp  246  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  80.35 
 
 		 1050 bp  244  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  79.51 
 
 		 1050 bp  236  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  77.68 
 
 		 1044 bp  218  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  80.94 
 
 		 1050 bp  210  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  78.39 
 
 		 1050 bp  206  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  78.39 
 
 		 1050 bp  206  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0403  rod shape-determining protein MreB  78.15 
 
 		 1050 bp  202  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  79.3 
 
 		 1050 bp  196  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  77.9 
 
 		 1050 bp  188  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  77.64 
 
 		 1044 bp  182  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  77.99 
 
 		 1050 bp  182  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3334  rod shape-determining protein MreB  80.76 
 
 		 1047 bp  180  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000427845  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0574  rod shape-determining protein MreB  77.95 
 
 		 1050 bp  180  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000161982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  79.49 
 
 		 1050 bp  180  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  81.3 
 
 		 1050 bp  176  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  78.78 
 
 		 1050 bp  172  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  79.72 
 
 		 1038 bp  161  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  78.6 
 
 		 1038 bp  123  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  79.43 
 
 		 1044 bp  123  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4561  rod shape-determining protein MreB  77.67 
 
 		 1044 bp  113  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  78.35 
 
 		 1038 bp  113  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  88 
 
 		 1038 bp  103  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  87.63 
 
 		 1038 bp  97.6  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  90 
 
 		 1038 bp  95.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  87 
 
 		 1038 bp  95.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3192  rod shape-determining protein MreB  85.98 
 
 		 1032 bp  93.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000467509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  87.64 
 
 		 1038 bp  89.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  79.38 
 
 		 1044 bp  89.7  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  78.33 
 
 		 1044 bp  85.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  80 
 
 		 1047 bp  85.7  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0116  rod shape-determining protein MreB  82 
 
 		 1044 bp  83.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  88.31 
 
 		 1038 bp  81.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  88.31 
 
 		 1038 bp  81.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  80 
 
 		 1038 bp  79.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0233  rod shape-determining protein MreB  86.9 
 
 		 1044 bp  79.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.731526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0239  rod shape-determining protein MreB  86.9 
 
 		 1044 bp  79.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.944455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  85.39 
 
 		 1044 bp  73.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1937  rod shape-determining protein MreB  90 
 
 		 1044 bp  71.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000814712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0354  rod shape-determining protein MreB  82.03 
 
 		 1044 bp  71.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0059  rod shape-determining protein MreB  81.68 
 
 		 1044 bp  69.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  81.68 
 
 		 1044 bp  69.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2021  rod shape-determining protein MreB  92.16 
 
 		 1044 bp  69.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0698648  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1738  rod shape-determining protein MreB  93.62 
 
 		 1044 bp  69.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.863773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  88.71 
 
 		 1041 bp  67.9  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0052  rod shape-determining protein MreB  82.2 
 
 		 1044 bp  67.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6461  rod shape-determining protein MreB  82.05 
 
 		 1044 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0146  rod shape-determining protein MreB  82.05 
 
 		 1044 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.949868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3107  rod shape-determining protein MreB  82.05 
 
 		 1044 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0222  rod shape-determining protein MreB  81.25 
 
 		 1044 bp  63.9  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  77.35 
 
 		 1044 bp  63.9  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  91.67 
 
 		 1041 bp  63.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  97.14 
 
 		 1047 bp  61.9  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  91.49 
 
 		 1044 bp  61.9  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0083  rod shape-determining protein MreB  85.92 
 
 		 1044 bp  61.9  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.400729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  80.92 
 
 		 1044 bp  61.9  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3690  rod shape-determining protein MreB  80.92 
 
 		 1044 bp  61.9  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2820  rod shape-determining protein MreB  91.11 
 
 		 1041 bp  58  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2496  rod shape-determining protein MreB  81.2 
 
 		 1044 bp  58  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3165  rod shape-determining protein MreB  81.2 
 
 		 1044 bp  58  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3110  rod shape-determining protein MreB  81.2 
 
 		 1044 bp  58  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  88.68 
 
 		 1035 bp  58  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 1107 bp  58  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0173  rod shape-determining protein MreB  86.89 
 
 		 1089 bp  58  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3126  rod shape-determining protein MreB  81.2 
 
 		 1044 bp  58  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0504  rod shape-determining protein MreB  91.11 
 
 		 1050 bp  58  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3048  rod shape-determining protein MreB  81.2 
 
 		 1044 bp  58  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0105  rod shape-determining protein MreB  94.44 
 
 		 1053 bp  56  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0330  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  88.46 
 
 		 1047 bp  56  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  85.29 
 
 		 1044 bp  56  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  87.5 
 
 		 1032 bp  56  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  84.51 
 
 		 1044 bp  54  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1630  rod shape-determining protein MreB  89.36 
 
 		 1047 bp  54  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0107268  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1127  rod shape-determining protein MreB  82.11 
 
 		 1056 bp  54  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000227657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>