More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5122 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5122  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  324  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0789  AsnC family transcriptional regulator  61.44 
 
 		 170 aa  205  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  61.44 
 
 		 195 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  61.44 
 
 		 169 aa  201  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3752  hypothetical protein  58.82 
 
 		 170 aa  200  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  61.38 
 
 		 166 aa  191  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 166 aa  188  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 169 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 169 aa  188  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 169 aa  187  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  57.72 
 
 		 166 aa  187  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  59.73 
 
 		 169 aa  186  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  58.39 
 
 		 169 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  60.56 
 
 		 167 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  60.56 
 
 		 167 aa  184  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  59.86 
 
 		 167 aa  183  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  56.38 
 
 		 160 aa  175  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  51.97 
 
 		 158 aa  173  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 160 aa  173  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  51.33 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  51.33 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  50.67 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 159 aa  171  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  51.68 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 168 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 168 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 198 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 198 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 		 163 aa  170  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  51.68 
 
 		 156 aa  169  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 282 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 156 aa  169  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2595  transcriptional regulator, AsnC family  54.36 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48.34 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  48.34 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 164 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  48.34 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  48.34 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  48.34 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  48.34 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  48.34 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  49.33 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6107  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2310  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 153 aa  156  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 169 aa  155  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  46.05 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03485  regulatory protein, AsnC/Lrp  44 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2868  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  45.33 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  46 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3081  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  46.31 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 178 aa  148  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3223  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1253  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.33 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>