More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4712 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4712  septum site-determining protein MinD  100 
 
 
245 aa  497  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.233951  decreased coverage  0.00864523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35120  septum site-determining protein MinD  70.66 
 
 
271 aa  342  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.53185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1881  cell division inhibitor MinD  69.42 
 
 
271 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22020  cell division inhibitor MinD  69.01 
 
 
271 aa  341  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0588924  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  68.18 
 
 
269 aa  339  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  67.36 
 
 
269 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000542736  unclonable  0.00000174808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1935  septum site-determining protein MinD  69.58 
 
 
269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1694  septum site-determining protein MinD  66.94 
 
 
270 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3873  septum site-determining protein MinD  67.77 
 
 
270 aa  334  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.748671  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1590  septum site-determining protein MinD  68.75 
 
 
269 aa  333  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.17933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1612  septum site-determining protein MinD  66.94 
 
 
270 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00643531  normal  0.221579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1234  septum site-determining protein MinD  67.36 
 
 
271 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246291  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1283  septum site-determining protein MinD  65.7 
 
 
270 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126659  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2336  septum site-determining protein MinD  67.92 
 
 
270 aa  332  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0379601  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1837  septum site-determining protein MinD  66.94 
 
 
269 aa  331  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1733  septum site-determining protein MinD  65.29 
 
 
270 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.270038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3986  septum site-determining protein MinD  65.29 
 
 
270 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346846  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1325  septum site-determining protein MinD  65.7 
 
 
270 aa  328  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  65.7 
 
 
269 aa  328  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2445  septum site-determining protein MinD  65.7 
 
 
269 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000350464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  64.88 
 
 
269 aa  325  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1546  septum site-determining protein MinD  64.2 
 
 
276 aa  324  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3342  septum site-determining protein MinD  66.94 
 
 
268 aa  324  8.000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2353  septum site-determining protein MinD  65.7 
 
 
277 aa  323  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.013257  normal  0.155337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2757  cell division inhibitor MinD  65.29 
 
 
270 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000621875  hitchhiker  0.001596 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1689  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  66.39 
 
 
276 aa  322  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1688  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  66.39 
 
 
276 aa  322  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2520  septum site-determining protein MinD  64.05 
 
 
269 aa  322  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147543  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3026  septum site-determining protein MinD  64.88 
 
 
272 aa  322  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  64.88 
 
 
269 aa  321  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1764  septum site-determining protein MinD  64.46 
 
 
269 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  64.46 
 
 
269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1364  septum site-determining protein MinD  64.34 
 
 
271 aa  319  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  319  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  65.71 
 
 
271 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2174  septum site-determining protein MinD  64.46 
 
 
269 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000643693  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2251  septum site-determining protein MinD  64.46 
 
 
269 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000178028  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1997  septum site-determining protein MinD  66.25 
 
 
269 aa  318  5e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122732  normal  0.207472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  318  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0320  septum site-determining protein MinD  65.71 
 
 
271 aa  317  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1931  septum site-determining protein MinD  64.05 
 
 
269 aa  318  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000172441  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0502  septum site-determining protein MinD  64.61 
 
 
271 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0531405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004087  septum site-determining protein MinD  63.79 
 
 
270 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000729512  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1894  septum site-determining protein MinD  64.05 
 
 
269 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000304586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2425  septum site-determining protein MinD  64.05 
 
 
269 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184306  normal  0.063488 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2372  cell division inhibitor MinD  64.88 
 
 
270 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000838785  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1867  septum site-determining protein MinD  64.05 
 
 
269 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1901  septum site-determining protein MinD  64.05 
 
 
269 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000001062  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0013  septum site-determining protein MinD  64.61 
 
 
269 aa  316  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0346954 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0012  septum site-determining protein MinD  64.61 
 
 
269 aa  316  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2235  cell division inhibitor MinD  63.64 
 
 
270 aa  315  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000561907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01150  membrane ATPase of the MinC-MinD-MinE system  64.46 
 
 
270 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2473  septum site-determining protein MinD  64.46 
 
 
270 aa  315  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1275  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  315  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000562763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1319  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  315  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1328  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  315  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000634164  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01160  hypothetical protein  64.46 
 
 
270 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2450  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  315  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00994868  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1974  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  315  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102785  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1660  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  315  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0966  septum site-determining protein MinD  63.93 
 
 
271 aa  314  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  64.49 
 
 
271 aa  314  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1628  septum site-determining protein MinD  62.81 
 
 
269 aa  314  7e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000684278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  64.05 
 
 
270 aa  314  8e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  64.05 
 
 
270 aa  314  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  64.05 
 
 
270 aa  314  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1957  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  314  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000405698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1502  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  314  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0106864  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1954  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  314  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00226645  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2014  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  314  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00470279  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1318  cell division inhibitor MinD  64.46 
 
 
270 aa  314  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000703051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01384  septum formation inhibitor-activating ATPase  63.37 
 
 
270 aa  313  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5651  septum site-determining protein MinD  63.67 
 
 
271 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531855  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2582  septum site-determining protein MinD  63.22 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2007  cell division inhibitor MinD  63.64 
 
 
270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04464  septum site-determining protein MinD  64.88 
 
 
269 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4341  septum site-determining protein MinD  63.67 
 
 
271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.243396 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0597  septum site-determining protein MinD  64.46 
 
 
269 aa  309  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.992631  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0679  septum site-determining protein  64.46 
 
 
269 aa  309  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1991  septum site-determining protein MinD  62.81 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1066  septum site-determining protein MinD (cell division inhibitor MinD)  63.37 
 
 
270 aa  308  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00857839  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1736  septum site-determining protein MinD  62.81 
 
 
269 aa  308  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1165  septum site-determining protein MinD  61.07 
 
 
270 aa  308  5e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000537171  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3507  cell division inhibitor  63.67 
 
 
271 aa  307  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00615597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3067  septum site-determining protein MinD  63.49 
 
 
269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1703  septum site-determining protein MinD  63.52 
 
 
272 aa  305  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0445  septum site-determining protein MinD  61 
 
 
270 aa  305  5.0000000000000004e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.103592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1095  septum site-determining protein MinD  64.05 
 
 
269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0092  septum site-determining protein MinD  61.32 
 
 
270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1218  septum site-determining protein MinD  64.2 
 
 
271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.637922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1429  septum site-determining protein MinD  64.2 
 
 
271 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1268  septum site-determining protein MinD  64.2 
 
 
271 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3688  septum site-determining protein MinD  63.18 
 
 
271 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525916  hitchhiker  0.000272147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0286  septum site-determining protein MinD  62.3 
 
 
271 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773057  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  58.02 
 
 
270 aa  300  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0066  septum site-determining protein MinD  62.14 
 
 
271 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3562  septum site-determining protein MinD  61.73 
 
 
273 aa  299  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2303  septum site-determining protein MinD  60.91 
 
 
271 aa  298  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  57.61 
 
 
270 aa  297  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3238  septum site-determining protein MinD  61.32 
 
 
272 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.442677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>